miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>40207_ath-MIR869:mirbase
Length = 295
Score = 579 bits (292), Expect = e-166
Identities = 294/295 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 14 gcccaccatacagatttccatacggtagaagaaagtatcacctatctcaactccaggatt 73
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gcccaccatacagatttccatacggtagaagaaagtatcacctatctcaactccaggatt 60
Query: 74 ggaccagtactaggctcatcatagttaagccacaatccacgattcctcatcagctataaa 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ggaccagtactaggctcatcatagttaagccacaatccacgattcctcatcagctataaa 120
Query: 134 agcaaaaccttcatatctatccttgtttctaaaccagtctcatagatatgaaggctttgt 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcaaaaccttcatatctatccttgtttctaaaccagtctcatagatatgaaggctttgt 180
Query: 194 ttctgatgaaggattgtgggattgttgcttaacactgatgagcatattattggttcaatt 253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttctgatgaaggattgtgggattgttgcttaacactgatgagcatattattggttcaatt 240
Query: 254 ctggtgttgagatagttgacacttcttataccgnatgaaaacatgtgtggtgggc 308
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctggtgttgagatagttgacacttcttataccgtatgaaaacatgtgtggtgggc 295
>40206_ath-MIR869:mirbase
Length = 295
Score = 579 bits (292), Expect = e-166
Identities = 294/295 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 14 gcccaccatacagatttccatacggtagaagaaagtatcacctatctcaactccaggatt 73
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gcccaccatacagatttccatacggtagaagaaagtatcacctatctcaactccaggatt 60
Query: 74 ggaccagtactaggctcatcatagttaagccacaatccacgattcctcatcagctataaa 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ggaccagtactaggctcatcatagttaagccacaatccacgattcctcatcagctataaa 120
Query: 134 agcaaaaccttcatatctatccttgtttctaaaccagtctcatagatatgaaggctttgt 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agcaaaaccttcatatctatccttgtttctaaaccagtctcatagatatgaaggctttgt 180
Query: 194 ttctgatgaaggattgtgggattgttgcttaacactgatgagcatattattggttcaatt 253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttctgatgaaggattgtgggattgttgcttaacactgatgagcatattattggttcaatt 240
Query: 254 ctggtgttgagatagttgacacttcttataccgnatgaaaacatgtgtggtgggc 308
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctggtgttgagatagttgacacttcttataccgtatgaaaacatgtgtggtgggc 295
>39944_aly-MIR869:mirbase
Length = 304
Score = 250 bits (126), Expect = 6e-67
Identities = 265/305 (86%), Gaps = 5/305 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 10 gtatgcccaccatacagatttccatacggtagaagaaagtatcacctatctcaactccag 69
|||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||
Sbjct: 1 gtatgctcaccacacagatttccatacagtaaaagaaagtatcacttatctcaaccctag 60
Query: 70 -gattggaccagtactaggctcatcatagttaagccacaatccacgattcctcatcagct 128
||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |
Sbjct: 61 tgattggaccagtactgtgctcatcataattgagccataattcacgattcctcatcagat 120
Query: 129 ataaaagcaaaaccttcatatctatccttgtttctaaaccagtctcatagat-atgaagg 187
| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||
Sbjct: 121 acaaagtcacaacctt-atattgtcccttgtttctaaaccaatctcacagattatgatgg 179
Query: 188 ctttgtttctgatgaaggattgtgggattgttgcttaacactgatgagcatattattggt 247
||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||
Sbjct: 180 ctttgtttctgatgaaggattttgg-attgtttcttaacactgagaagcacattgttggt 238
Query: 248 tcaattc-tggtgttgagatagttgacacttcttataccgnatgaaaacatgtgtggtgg 306
||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 239 tcaattcctgggtttgagataattgacacttcttataccgtatgaaaacatgtgtggtgg 298
Query: 307 gctta 311
|||||
Sbjct: 299 gctta 303
