miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>33193_bta-mir-105b:mirbase
Length = 80
Score = 151 bits (76), Expect = 9e-38
Identities = 79/80 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactccttggtggctgcttatgcaccacggatgtttg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactccttggtggctgcttatgcaccatggatgtttg 60
Query: 61 agcatgtgctatggtgtcta 80
||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 agcatgtgctatggtgtcta 80
>27710_mml-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 145 bits (73), Expect = 5e-36
Identities = 80/81 (98%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>28422_hsa-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 145 bits (73), Expect = 5e-36
Identities = 80/81 (98%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>30203_ptr-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 145 bits (73), Expect = 5e-36
Identities = 80/81 (98%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>30810_ppy-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 145 bits (73), Expect = 5e-36
Identities = 80/81 (98%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>26681_cfa-mir-105b:mirbase
Length = 80
Score = 135 bits (68), Expect = 5e-33
Identities = 77/80 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactccttggtggctgcttatgcaccacggatgtttg 60
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcatggtcaaatgctcagactccttggtggctgcttatgcaccatgaatgtttg 60
Query: 61 agcatgtgctatggtgtcta 80
||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 agcatgtgctatggtgtcta 80
>27566_lla-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>27612_sla-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>27709_mml-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>28204_mne-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>28296_ggo-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>28421_hsa-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>30083_ppa-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>30809_ppy-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 78/81 (96%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>26680_cfa-mir-105a:mirbase
Length = 81
Score = 121 bits (61), Expect = 8e-29
Identities = 77/81 (95%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>33192_bta-mir-105a:mirbase
Length = 81
Score = 121 bits (61), Expect = 8e-29
Identities = 77/81 (95%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>33963_ssc-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 121 bits (61), Expect = 8e-29
Identities = 77/81 (95%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>27001_eca-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 113 bits (57), Expect = 2e-26
Identities = 76/81 (93%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
Query: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>32713_rno-mir-105:mirbase
Length = 73
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-15
Identities = 47/50 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 31 tggtggctgcttatgcaccacggatgtttgagcatgtgctatggtgtcta 80
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 23 tggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgctatggtatcta 72
>31833_mmu-mir-105:mirbase
Length = 80
Score = 73.8 bits (37), Expect = 2e-14
Identities = 43/45 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 31 tggtggctgcttatgcaccacggatgtttgagcatgtgctatggt 75
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 30 tggtggctgcttatgcaccacgaatgcttgagcatgtgctatggt 74
