miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST


BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>36200_der-mir-280:mirbase
          Length = 89

 Score =  153 bits (77), Expect = 2e-38
 Identities = 77/77 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36423_dme-mir-280:mirbase
          Length = 95

 Score =  153 bits (77), Expect = 2e-38
 Identities = 77/77 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>37160_dse-mir-280:mirbase
          Length = 87

 Score =  153 bits (77), Expect = 2e-38
 Identities = 77/77 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>37529_dya-mir-280:mirbase
          Length = 87

 Score =  151 bits (76), Expect = 9e-38
 Identities = 76/76 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>37374_dvi-mir-280:mirbase
          Length = 80

 Score =  141 bits (71), Expect = 8e-35
 Identities = 71/71 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>37453_dwi-mir-280:mirbase
          Length = 81

 Score =  141 bits (71), Expect = 8e-35
 Identities = 74/75 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36874_dpe-mir-280:mirbase
          Length = 87

 Score =  139 bits (70), Expect = 3e-34
 Identities = 73/74 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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Sbjct: 61 tgcaggtatgtgca 74




>36954_dps-mir-280:mirbase
          Length = 94

 Score =  139 bits (70), Expect = 3e-34
 Identities = 73/74 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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Sbjct: 61 tgcaggtatgtgca 74




>36797_dmo-mir-280:mirbase
          Length = 83

 Score =  137 bits (69), Expect = 1e-33
 Identities = 69/69 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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Sbjct: 63 gcaggtata 71




>36289_dgr-mir-280:mirbase
          Length = 72

 Score =  131 bits (66), Expect = 8e-32
 Identities = 66/66 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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Sbjct: 1  tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 60

                
Query: 66 ggtata 71
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Sbjct: 61 ggtata 66