miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST


BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>37374_dvi-mir-280:mirbase
          Length = 80

 Score =  153 bits (77), Expect = 2e-38
 Identities = 77/77 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36289_dgr-mir-280:mirbase
          Length = 72

 Score =  141 bits (71), Expect = 9e-35
 Identities = 71/71 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36122_dan-mir-280:mirbase
          Length = 79

 Score =  137 bits (69), Expect = 1e-33
 Identities = 69/69 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36200_der-mir-280:mirbase
          Length = 89

 Score =  137 bits (69), Expect = 1e-33
 Identities = 69/69 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36423_dme-mir-280:mirbase
          Length = 95

 Score =  137 bits (69), Expect = 1e-33
 Identities = 69/69 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>37160_dse-mir-280:mirbase
          Length = 87

 Score =  137 bits (69), Expect = 1e-33
 Identities = 69/69 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>37529_dya-mir-280:mirbase
          Length = 87

 Score =  137 bits (69), Expect = 1e-33
 Identities = 69/69 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36874_dpe-mir-280:mirbase
          Length = 87

 Score =  135 bits (68), Expect = 5e-33
 Identities = 68/68 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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>36954_dps-mir-280:mirbase
          Length = 94

 Score =  135 bits (68), Expect = 5e-33
 Identities = 68/68 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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Sbjct: 62 gcaggtat 69




>37453_dwi-mir-280:mirbase
          Length = 81

 Score =  135 bits (68), Expect = 5e-33
 Identities = 68/68 (100%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
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Query: 63 gcaggtat 70
          ||||||||
Sbjct: 62 gcaggtat 69