miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>40887_mtr-MIR2630h:mirbase
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Query: 197 ggaccaaaaccaaatattctatatttg 223
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Sbjct: 62 catttcatattaaaattggtccctataatattcattttagttctcattttgagggactaa 121
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Sbjct: 122 aattaaatattctacatattacaaggaccaaatcgaatatgaatcaattttacaaggact 181
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Sbjct: 182 aaaacaaaacaccaaggaccaaaacccaattttttatatttgca 225
Score = 107 bits (54), Expect = 4e-24
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Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 227 cctgcaaatataaaaaattgggttttggtccttggtgttttgttttagtccttgtaaaat 168
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Sbjct: 2 cctgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttataaaat 61
Query: 62 catttcatattaaaattggtccctataatattcattttagtcctcattttgagggactaa 121
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Sbjct: 62 catttcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcattttgagggactaa 121
Query: 122 aatcaaatattcgacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggact 181
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Sbjct: 122 aatcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaattaattttacaaggact 181
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Sbjct: 182 aaaacaaaatatcaaggatcaaaaccaaattttttatatttgca 225
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Query: 182 aaaacaaaataccaaggaccaaaaccaaatattctatatttgca 225
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Sbjct: 182 aaaataaaatacagaggaccaaaaccaaattttttatatttgca 225
Score = 105 bits (53), Expect = 1e-23
Identities = 80/89 (89%)
Strand = Plus / Minus
Query: 137 atattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattgaaacaaaataccaa 33
Query: 197 ggaccaaaaccaaatattctatatttgca 225
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattctatatttgca 4
Score = 56.0 bits (28), Expect = 1e-08
Identities = 52/60 (86%)
Strand = Plus / Minus
Query: 2 cctgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaat 61
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Sbjct: 227 cctgcaaatataaaaaatttggttttggtcctctgtattttattttagtctttgaaaaat 168
