miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>40880_mtr-MIR2630a:mirbase
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Sbjct: 121 aaatcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaattaattttacaaggac 180
Query: 181 taaaacaaaataccaaagaccaaaaccaaatattttatatttgcagg 227
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Sbjct: 181 taaaacaaaatatcaaggatcaaaaccaaattttttatatttgcagg 227
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattaaaacaaaataccaa 33
Query: 197 agaccaaaaccaaatattttatatttgcaggg 228
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattatatatttgcaggg 1
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Strand = Plus / Minus
Query: 137 atattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattgaaacaaaataccaa 33
Query: 197 agaccaaaaccaaatattttatatttgcaggg 228
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattctatatttgcaggg 1
Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-09
Identities = 53/61 (86%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ccctgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaa 60
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Sbjct: 228 ccctgcaaatataaaaaatttggttttggtcctctgtattttattttagtctttgaaaaa 169
Query: 61 t 61
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Sbjct: 168 t 168
>40882_mtr-MIR2630c:mirbase
Length = 229
Score = 351 bits (177), Expect = 1e-97
Identities = 210/221 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6 caaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaatcatt 65
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Sbjct: 6 caaataaagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatctttgtaaaatcatt 65
Query: 66 tcatattgaaatcggtccctataatattcattttagtcctcattttgaatgactaaaatc 125
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Sbjct: 66 tcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcgttttgagggactaaaatc 125
Query: 126 aaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaaaa 185
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Sbjct: 126 aaatattctacctattacaaagaccaaatccaatatgaatctattttacaaggactaaaa 185
Query: 186 caaaataccaaagaccaaaaccaaatattttatatttgcag 226
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Sbjct: 186 caaaataccaaggaccaaaaccaaattttttatatttgcag 226
Score = 93.7 bits (47), Expect = 6e-20
Identities = 56/59 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 ctgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaat 61
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Sbjct: 226 ctgcaaatataaaaaatttggttttggtccttggtattttgttttagtccttgtaaaat 168
Score = 77.8 bits (39), Expect = 3e-15
Identities = 75/87 (86%)
Strand = Plus / Minus
Query: 137 atattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaagattaaaacaaaataccaa 33
Query: 197 agaccaaaaccaaatattttatatttg 223
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattctttatttg 6
