miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>40885_mtr-MIR2630f:mirbase
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Query: 121 aaatcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatga-atcaattttacaagga 179
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Sbjct: 61 tcatttcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcattttgagggacta 120
Query: 121 aaatcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggac 180
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Sbjct: 121 aaatcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcacttttacaaggac 180
Query: 181 taaaacaaaataccaaggaccaaaaccaaattttttatatttgca 225
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Sbjct: 181 taaaacaaaataccaaggaccaaaaccaaattttctatatttgca 225
Score = 89.7 bits (45), Expect = 9e-19
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Query: 4 tgcaaatatataatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaa 60
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Sbjct: 225 tgcaaatatagaaaatttggttttggtccttggtattttgttttagtccttgtaaaa 169
Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-17
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Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaagattaaaacaaaataccaa 33
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattctatatttg 6
>40894_mtr-MIR2630o:mirbase
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Sbjct: 4 tgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttataaaatca 63
Query: 64 tttcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcgttttgagggactaaaa 123
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Sbjct: 64 tttcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcattttgagggactaaaa 123
Query: 124 tcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaa 183
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Sbjct: 124 tcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaattaattttacaaggactaa 183
Query: 184 aacaaaataccaaggaccaaaaccaaattttttatatttgcagg 227
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 aacaaaatatcaaggatcaaaaccaaattttttatatttgcagg 227
Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-20
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Strand = Plus / Minus
Query: 137 atattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttataaggattaaaacaaaataccaa 33
Query: 197 ggaccaaaaccaaattttttatatttgcaggg 228
||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattctatatttgcaggg 1
Score = 89.7 bits (45), Expect = 9e-19
Identities = 78/89 (87%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4 tgcaaatatataatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaatca 63
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Sbjct: 225 tgcaaatataaaaaatttggttttgatccttgatattttgttttagtccttgtaaaatta 166
Query: 64 tttcatattgaaattggtccctataatat 92
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Sbjct: 165 attcatattggatttggtccttgtaatat 137
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Length = 229
Score = 396 bits (200), Expect = e-111
Identities = 215/220 (97%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 124 tcaaatattctacatactacaagaacaaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaa 183
Query: 184 aacaaaataccaaggaccaaaaccaaattttttatatttgcagg 227
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Sbjct: 184 aacaaaataccaaggaccaaaaccaaatttttaatatttgcagg 227
Score = 103 bits (52), Expect = 6e-23
Identities = 82/92 (89%)
Strand = Plus / Minus
Query: 137 atattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 92 atattatatggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattaaaacaaaataccaa 33
Query: 197 ggaccaaaaccaaattttttatatttgcaggg 228
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattctatatttgcaggg 1
Score = 83.8 bits (42), Expect = 5e-17
Identities = 54/58 (93%)
Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 225 tgcaaatattaaaaatttggttttggtccttggtattttgttttagtccttgtaaaat 168
>40886_mtr-MIR2630g:mirbase
Length = 229
Score = 367 bits (185), Expect = e-102
Identities = 215/225 (95%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 4 tgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgtttcaatccttgtaaaatca 63
Query: 64 tttcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcgttttgagggactaaaa 123
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Sbjct: 64 tttcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcattttgagggacaaaaa 123
Query: 124 tcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaa 183
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Sbjct: 124 tcaaatattttacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaatttttcaaagactaa 183
Query: 184 aacaaaataccaaggaccaaaaccaaattttttatatttgcaggg 228
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Score = 95.6 bits (48), Expect = 1e-20
Identities = 81/92 (88%)
Strand = Plus / Minus
Query: 137 atattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattgaaacaaaataccaa 33
Query: 197 ggaccaaaaccaaattttttatatttgcaggg 228
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Score = 58.0 bits (29), Expect = 3e-09
Identities = 74/89 (83%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4 tgcaaatatataatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaatca 63
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Sbjct: 225 tgcaaatataaaaaatttggttttggtcctctgtattttattttagtctttgaaaaattg 166
Query: 64 tttcatattgaaattggtccctataatat 92
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Sbjct: 165 attcatattggatttggtccttgtaatat 137
