miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>40880_mtr-MIR2630a:mirbase
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|
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Sbjct: 124 tcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggactaa 183
Query: 184 aacaaaataccaaggaccaaaatcaaattttttatatttgcaggg 228
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Query: 61 t 61
|
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|
Sbjct: 61 t 61
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Sbjct: 121 aaatcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatatgaatcaattttacaaggac 180
Query: 181 taaaacaaaataccaaggaccaaaatcaaattttttatatttgca 225
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Score = 87.7 bits (44), Expect = 3e-18
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Strand = Plus / Minus
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Score = 85.7 bits (43), Expect = 1e-17
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Query: 61 t 61
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Sbjct: 121 aaatcaaatattctacatattacaaggaccaaatccaatataaatcaattttacaaggat 180
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattaaaacaaaataccaa 33
Query: 197 ggaccaaaatcaaattttttatatttgcaggg 228
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattatatatttgcaggg 1
>40884_mtr-MIR2630e:mirbase
Length = 229
Score = 375 bits (189), Expect = e-104
Identities = 216/225 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 ccctgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaa 60
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Sbjct: 1 ccctgcaaatatataatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaa 60
Query: 61 tcatttcatgttgaaattggtccctataatattcattttagtcttcattttgagggacta 120
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Sbjct: 181 taaaacaaaataccaaggaccaaaaccaaattttttatatttgca 225
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Identities = 81/92 (88%)
Strand = Plus / Minus
Query: 137 atattacaaggaccaaattcaatatgaatcaattttacaaagactaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattaaaacaaaataccaa 33
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Sbjct: 181 taaaacaaaataccaaggaccaaaaccaaatttttaatatttgcagg 227
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Sbjct: 92 atattatatggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattaaaacaaaataccaa 33
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Sbjct: 32 ggaccaaaaccaaatattctatatttgcaggg 1
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Sbjct: 64 tttcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcgttttgagggactaaaa 123
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Sbjct: 162 tcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcgttttgagggactaaaatc 103
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Sbjct: 102 aaatattctacctattacaaagaccaaatccaatatgaatctattttacaaggactaaaa 43
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 66 tcatattgaaattggtccctataatattcattttagtcctcgttttgagggactaaaatc 125
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Query: 3 ctgcaaatatagaatatttggttttggtccttggtattttgttttaatccttgtaaaat 61
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Sbjct: 92 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaagattaaaacaaaataccaa 33
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