miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>40887_mtr-MIR2630h:mirbase
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Sbjct: 197 ggaccaaaatcaaattttttatatttg 223
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Sbjct: 147 ccttgtaatatgtagaatatttgattttagtccctcaaaacgaggactaaaatgaatatt 88
Query: 142 atagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggatcaaaacaaaataccaaggacc 201
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Sbjct: 87 atagggaccaatttcaataagaaatgattttacaaggattaaaacaaaataccaaggacc 28
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Query: 80 gtctttgtaatatgtagaatatttgattttagtccctcaaaatgaggactaaaatgaata 139
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Sbjct: 149 gtccttgtaatatgtaaaatatttgatttttgtccctcaaaatgaggactaaaatgaata 90
Query: 140 ttatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggatcaaaacaaaataccaagga 199
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Sbjct: 89 ttatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggattgaaacaaaataccaagga 30
Query: 200 ccaaaaccaaatattctatatttgcagg 227
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Sbjct: 29 ccaaaaccaaatattctatatttgcagg 2
Score = 69.9 bits (35), Expect = 8e-13
Identities = 56/63 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 20 ttggttttggtccttggtattttgttttagtccttgtaaaattgattcatattggatttg 79
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Sbjct: 20 ttggttttggtccttggtattttgtttcaatccttgtaaaatcatttcatattgaaattg 79
Query: 80 gtc 82
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Sbjct: 80 gtc 82
Score = 54.0 bits (27), Expect = 5e-08
Identities = 75/91 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 137 atattatagggaccaatttcaatatgaaatgattttacaaggatcaaaacaaaataccaa 196
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Sbjct: 137 atattacaaggaccaaatccaatatgaatcaatttttcaaagactaaaataaaatacaga 196
Query: 197 ggaccaaaaccaaatattctatatttgcagg 227
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Sbjct: 197 ggaccaaaaccaaattttttatatttgcagg 227
