miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
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|
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Sbjct: 142 gtttcataatgtaagtcattctaccatttcccacatttatattgatg 96
Score = 46.1 bits (23), Expect = 8e-06
Identities = 23/23 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 atattgatgttaatgaatctaga 72
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Sbjct: 64 atattgatgttaatgaatctaga 86
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Score = 69.9 bits (35), Expect = 5e-13
Identities = 101/122 (82%), Gaps = 2/122 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 36 catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
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Sbjct: 47 cattgcctacattcatatagatgttaatgaatctag--gcacacatatatgtctagattc 104
Query: 96 attaacaccaatataaatgtgggaaatgcttgaatgacttacattgtgaaacggaggaag 155
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Sbjct: 105 attaacatatatatgaatgtgggcaatgctagaaagttttataatatgaaacggaggaag 164
Query: 156 ta 157
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Sbjct: 165 ta 166
Score = 46.1 bits (23), Expect = 8e-06
Identities = 59/70 (84%), Gaps = 2/70 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 atgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaatgt 115
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Sbjct: 112 atgttaatgaatctagaca--tatatgtgtgcctagattcattaacatctatatgaatgt 55
Query: 116 gggaaatgct 125
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Sbjct: 54 aggcaatgct 45
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Length = 154
Score = 69.9 bits (35), Expect = 5e-13
Identities = 95/114 (83%), Gaps = 2/114 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 44 acatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacac 103
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Sbjct: 43 acattcatatagatgttaatgaatctag--gcacacatatatgtctagattcattaacat 100
Query: 104 caatataaatgtgggaaatgcttgaatgacttacattgtgaaacggaggaagta 157
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Sbjct: 101 atatatgaatgtgggcaatgctagaaagccttataatatgaaacggaggaagta 154
Score = 54.0 bits (27), Expect = 3e-08
Identities = 60/70 (85%), Gaps = 2/70 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 atgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaatgt 115
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Sbjct: 100 atgttaatgaatctagaca--tatatgtgtgcctagattcattaacatctatatgaatgt 43
Query: 116 gggaaatgct 125
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Sbjct: 42 gggcaatgct 33
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Length = 154
Score = 61.9 bits (31), Expect = 1e-10
Identities = 94/114 (82%), Gaps = 2/114 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 44 acatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacac 103
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Sbjct: 43 acattcatatagatgttaatgaatctag--gcacacatatatgtctagattcattagcat 100
Query: 104 caatataaatgtgggaaatgcttgaatgacttacattgtgaaacggaggaagta 157
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Sbjct: 101 atatatgaatgtgggcaatgctagaaagtcttataatatgaaacggaggaagta 154
Score = 46.1 bits (23), Expect = 8e-06
Identities = 56/66 (84%), Gaps = 2/66 (3%)
Strand = Plus / Minus
Query: 60 taatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaatgtggga 119
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Sbjct: 96 taatgaatctagaca--tatatgtgtgcctagattcattaacatctatatgaatgtgggc 39
Query: 120 aatgct 125
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Sbjct: 38 aatgct 33
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Length = 166
Score = 61.9 bits (31), Expect = 1e-10
Identities = 61/70 (87%), Gaps = 2/70 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 56 atgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaatgt 115
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Sbjct: 106 atgttaatgaatctagaca--tatatgtatgtctagattcattaatatctatatgaatgt 49
Query: 116 gggaaatgct 125
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Sbjct: 48 gggtaatgct 39
Score = 61.9 bits (31), Expect = 1e-10
Identities = 94/114 (82%), Gaps = 2/114 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 44 acatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacac 103
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Sbjct: 49 acattcatatagatattaatgaatctagaca--tacatatatgtctagattcattaacat 106
Query: 104 caatataaatgtgggaaatgcttgaatgacttacattgtgaaacggaggaagta 157
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Sbjct: 107 atatatgaatgttgataatgctagaaagtcttataatatgaaacggaggaagta 160
