miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>54903_vvi-miR845a:pmrd
Length = 442
Score = 876 bits (442), Expect = 0.0
Identities = 442/442 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttcacttgattagttccttcatgagttattgcaagtaatctccaaatttccttagcgga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tttcacttgattagttccttcatgagttattgcaagtaatctccaaatttccttagcgga 60
Query: 61 tttacattgacatattctattatattcattcctatccatagcacattgcaaagtaaaaac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tttacattgacatattctattatattcattcctatccatagcacattgcaaagtaaaaac 120
Query: 121 gactttagcatttaattgaaaatttcttctatcaagctcattccattcttgcttgggttt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gactttagcatttaattgaaaatttcttctatcaagctcattccattcttgcttgggttt 180
Query: 181 tggaaccaaaattccatcaactaatttagtgggtaaagttgggccatcttcaatggcatc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tggaaccaaaattccatcaactaatttagtgggtaaagttgggccatcttcaatggcatc 240
Query: 241 ccatacatctaaatcagttgattgtaagtaccaagtcattctagctttccaatagggata 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ccatacatctaaatcagttgattgtaagtaccaagtcattctagctttccaatagggata 300
Query: 301 gtcggttcccgtaaagaatggagctctatgttttgaacaattttcagtttgagatgagct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtcggttcccgtaaagaatggagctctatgttttgaacaattttcagtttgagatgagct 360
Query: 361 tgatggaatagccattttcctcttagatgattaagtcttaagcaagaggtctagctctga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tgatggaatagccattttcctcttagatgattaagtcttaagcaagaggtctagctctga 420
Query: 421 taccaattgataaaacaaaggc 442
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 taccaattgataaaacaaaggc 442
>54904_vvi-miR845b:pmrd
Length = 442
Score = 789 bits (398), Expect = 0.0
Identities = 431/442 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttcacttgattagttccttcatgagttattgcaagtaatctccaaatttccttagcgga 60
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1 tttcacttgattagttccttcatgagttatttcaagcaatctccaaatttccttagcaga 60
Query: 61 tttacattgacatattctattatattcattcctatccatagcacattgcaaagtaaaaac 120
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tttacattggcatattctattatattcattcctatccatagcacattgcaaagtaaaaac 120
Query: 121 gactttagcatttaattgaaaatttcttctatcaagctcattccattcttgcttgggttt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 121 gactttagcatttaattgaaaatttcttctatcaagctcattccattcttgcttgagttt 180
Query: 181 tggaaccaaaattccatcaactaatttagtgggtaaagttgggccatcttcaatggcatc 240
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 181 tggaaccaaaactccatcaactaatttagtgggaaaagttgggccatcttcaatgacatc 240
Query: 241 ccatacatctaaatcagttgattgtaagtaccaagtcattctagctttccaatagggata 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 241 ccatacatctaaatcagttgattgtaagtaccaagtcattctaactttccaatagggata 300
Query: 301 gtcggttcccgtaaagaatggagctctatgttttgaacaattttcagtttgagatgagct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtcggttcccgtaaagaatggagctctatgttttgaacaattttcagtttgagatgagct 360
Query: 361 tgatggaatagccattttcctcttagatgattaagtcttaagcaagaggtctagctctga 420
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tgatggaacaaccattttcctcttagatgattaagtcttaagcaagaggtctagctctga 420
Query: 421 taccaattgataaaacaaaggc 442
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 taccaattgataaaacaaaggc 442
