miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>48392_bol-miR824:pmrd
Length = 634
Score = 1207 bits (609), Expect = 0.0
Identities = 611/612 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtctttcatgtctagaccatttgtgagaagggattttttgtttgcaccgttcaccccac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 9 tgtctttcatgtctagaccatttgtgagaagggattttttgtttgcaccgttcaccccac 68
Query: 61 tttcaatctgtagtgagtattaaggaaaatagcttgttcaacatatcacactactctttt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 tttcaatctgtagtgagtattaaggaaaatagcttgttcaacatatcacactactctttt 128
Query: 121 agaaacaatactatattttagatgcttttccagcttgatatacgttgttttgttatgtat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 agaaacaatactatattttagatgcttttccagcttgatatacgttgttttgttatgtat 188
Query: 181 atctgtattatcccggctaccaaaacgttaagaaataaggtgaacatcctaaaacctgca 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 atctgtattatcccggctaccaaaacgttaagaaataaggtgaacatcctaaaacctgca 248
Query: 241 tccaattagaaaggtctaggtcacagatattacttgttatctcttgattaagctatttta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 tccaattagaaaggtctaggtcacagatattacttgttatctcttgattaagctatttta 308
Query: 301 tttctatcagcatgatcagatcattcaggagttaagtataaactaaaatacattaagtcc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 tttctatcagcatgatcagatcattcaggagttaagtataaactaaaatacattaagtcc 368
Query: 361 attcatgacatttctggatgctgcatacataatattttccttgtttttggactatgccac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 attcatgacatttctggatgctgcatacataatattttccttgtttttggactatgccac 428
Query: 421 acttcggacagacattttgcctaagagatgtcaaacctctgtctggagtgttagaggtat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 acttcggacagacattttgcctaagagatgtcaaacctctgtctggagtgttagaggtat 488
Query: 481 ttcatgatagctaagaacttgaatcttgcactacttagctacactagattacttcatagt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 ttcatgatagctaagaacttgaatcttgcactacttagctacactagattacttcatagt 548
Query: 541 aaataacttggggagtgggggaaggtgctgggttattattcccttctcatcgatggtcta 600
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 aaataacttggggagtgggggaaggtgctgggntattattcccttctcatcgatggtcta 608
Query: 601 gatgtgcgaggt 612
||||||||||||
Sbjct: 609 gatgtgcgaggt 620
>48411_bra-miR824:pmrd
Length = 632
Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0
Identities = 591/615 (96%), Gaps = 8/615 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtctttcatgtctagaccatttgtgagaagggattttttgtttgcaccgttcaccccac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 9 tgtctttcatgtctagaccatttgtgagaagggattttttgtttgcaccgttcaccccac 68
Query: 61 tttcaatctgtagtgagtattaaggaaaatagcttgttcaacatatcacactactctttt 120
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 tctcaatctgtagtgagtattaaggaaaatagcttgttcaacatatcacactactctttt 128
Query: 121 agaaacaatactatattttagatgcttttccagcttgatatacgttgttttgttatgtat 180
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 agaaacaaaactatattttagatgcttttccagcttgatatacgttgttttgttatgtat 188
Query: 181 atctgtattatcccggctaccaaaacgttaagaaataaggtgaacat---cctaaaacct 237
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct: 189 acctgtattctcccggctaccaaaacgttaagaaataaggtgaacatctccccaaaacct 248
Query: 238 gcatccaattagaaaggtctaggtcacagatattacttgttatctcttgattaagctatt 297
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct: 249 gcatccaattagaaaggtctaggtcacagccattacttgctatctctcgattaagctatt 308
Query: 298 ttatttctatcagcatgatcagatcattcaggagttaagtataaactaaaatacattaag 357
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 309 ttatttctatcatcatcatcagatcattcaggagttaagtataaaataaaatacattaag 368
Query: 358 tccattcatgacatttctggatgctgcatacataatattttccttgtttttggactatgc 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 369 tccattcatgacatttctggatgctgcatacataatatt----ttgtttttggactatgc 424
Query: 418 cacacttcggacagacattttgcctaagagatgtcaaacctctgtctggagtgttagagg 477
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 cacacttcggacagacatttttcctacgagatgtcaaacctctgtctggagtgttagagg 484
Query: 478 tatttcatgatagctaagaacttgaatcttgcactacttagctacactagattacttcat 537
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 485 tatttcatgatagctaagaacttgaatcttgcactacttagctacactagtttacttcat 544
Query: 538 agtaaataacttggggagtgggggaaggtgctgggttattattcccttctcatcgatggt 597
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 545 agtaaataacttggggagt-ggggaaggtgctgggttattagtcccttctcatcgatggt 603
Query: 598 ctagatgtgcgaggt 612
|||||||||||||||
Sbjct: 604 ctagatgtgcgaggt 618
>48378_bna-miR824:pmrd
Length = 632
Score = 1015 bits (512), Expect = 0.0
Identities = 591/615 (96%), Gaps = 8/615 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtctttcatgtctagaccatttgtgagaagggattttttgtttgcaccgttcaccccac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 9 tgtctttcatgtctagaccatttgtgagaagggattttttgtttgcaccgttcaccccac 68
Query: 61 tttcaatctgtagtgagtattaaggaaaatagcttgttcaacatatcacactactctttt 120
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 tctcaatctgtagtgagtattaaggaaaatagcttgttcaacatatcacactactctttt 128
Query: 121 agaaacaatactatattttagatgcttttccagcttgatatacgttgttttgttatgtat 180
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 agaaacaaaactatattttagatgcttttccagcttgatatacgttgttttgttatgtat 188
Query: 181 atctgtattatcccggctaccaaaacgttaagaaataaggtgaacat---cctaaaacct 237
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct: 189 acctgtattctcccggctaccaaaacgttaagaaataaggtgaacatctccccaaaacct 248
Query: 238 gcatccaattagaaaggtctaggtcacagatattacttgttatctcttgattaagctatt 297
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct: 249 gcatccaattagaaaggtctaggtcacagccattacttgctatctctcgattaagctatt 308
Query: 298 ttatttctatcagcatgatcagatcattcaggagttaagtataaactaaaatacattaag 357
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 309 ttatttctatcatcatcatcagatcattcaggagttaagtataaaataaaatacattaag 368
Query: 358 tccattcatgacatttctggatgctgcatacataatattttccttgtttttggactatgc 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 369 tccattcatgacatttctggatgctgcatacataatatt----ttgtttttggactatgc 424
Query: 418 cacacttcggacagacattttgcctaagagatgtcaaacctctgtctggagtgttagagg 477
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 cacacttcggacagacatttttcctacgagatgtcaaacctctgtctggagtgttagagg 484
Query: 478 tatttcatgatagctaagaacttgaatcttgcactacttagctacactagattacttcat 537
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 485 tatttcatgatagctaagaacttgaatcttgcactacttagctacactagtttacttcat 544
Query: 538 agtaaataacttggggagtgggggaaggtgctgggttattattcccttctcatcgatggt 597
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 545 agtaaataacttggggagt-ggggaaggtgctgggttattagtcccttctcatcgatggt 603
Query: 598 ctagatgtgcgaggt 612
|||||||||||||||
Sbjct: 604 ctagatgtgcgaggt 618
>47057_ath-miR824:pmrd
Length = 689
Score = 73.8 bits (37), Expect = 1e-13
Identities = 46/49 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtctttcatgtctagaccatttgtgagaagggattttttgtttgcacc 49
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct: 22 tgtctctcatgtctagaccatttgtgagaagggagtttttgtttacacc 70
Score = 71.9 bits (36), Expect = 6e-13
Identities = 36/36 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 577 tattcccttctcatcgatggtctagatgtgcgaggt 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 tattcccttctcatcgatggtctagatgtgcgaggt 658
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-04
Identities = 36/41 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 352 attaagtccattcatgacatttctggatgctgcatacataa 392
||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||
Sbjct: 457 attaagttcattcatgacttttccagatgttgcatacataa 497
