miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>RF00801;mir-280;AAPT01021476.1/37912-38002 7222:Drosophila
grimshawi
Length = 91
Score = 143 bits (72), Expect = 3e-34
Identities = 72/72 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 60
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Sbjct: 6 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 65
Query: 61 ggtatacatgca 72
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Sbjct: 66 ggtatacatgca 77
>RF00801;mir-280;AAPU01010189.1/60454-60360 7230:Drosophila
mojavensis
Length = 95
Score = 141 bits (71), Expect = 1e-33
Identities = 71/71 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 60
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Sbjct: 6 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 65
Query: 61 ggtatacatgc 71
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Sbjct: 66 ggtatacatgc 76
>RF00801;mir-280;AANI01014841.1/76079-76175 7244:Drosophila
virilis
Length = 97
Score = 141 bits (71), Expect = 1e-33
Identities = 71/71 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 60
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Sbjct: 6 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 65
Query: 61 ggtatacatgc 71
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Sbjct: 66 ggtatacatgc 76
>RF00801;mir-280;AAPP01018712.1/27830-27743 7217:Drosophila
ananassae
Length = 88
Score = 131 bits (66), Expect = 1e-30
Identities = 66/66 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 60
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Sbjct: 6 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 65
Query: 61 ggtata 66
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Sbjct: 66 ggtata 71
>RF00801;mir-280;AAQB01006287.1/166688-166782 7260:Drosophila
willistoni
Length = 95
Score = 129 bits (65), Expect = 5e-30
Identities = 65/65 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 60
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Sbjct: 6 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 65
Query: 61 ggtat 65
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Sbjct: 66 ggtat 70
