miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: deep sequencing predictions



Please select library, species and/or miRNA sequence.


selected mature miRNA sequence: TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT

selected species: Mus musculus



27 records found  

#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
1 Mus musculus GSM527274-2107 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----ACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	18
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	9
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	8
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	92
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	249
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	58
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	2
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	14081
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	17858
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2284
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	168
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	177912
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	5
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	61272
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	150
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	68
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	633
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1641
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	91
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	12
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	268
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3622
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	38
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTAA 	3
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGT 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTT 	3
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTA 	3
-------------------------------------------------------GAGTTACACCCTGGGAGTT 	1
------------------------------------------------------------------------TTAACTGTACAACCTTCTAGCT 	2
------------------------------------------------------------------------TTAACTGTACAACCTTCTAGC 	1
-------------------------------------------------------------------------TAACTGTACAACCTTCTAGCTTT 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	3
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	24
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTT 	1
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	5
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	1
------------------------------------------------------------------------------GTACAACCTTCTAGCTTTC 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
2 Mus musculus GSM527280 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----AACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	6
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	61
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	17
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	16
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4106
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	16487
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	594
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	3668
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	59
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	38918
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	310
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	16
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	40
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	120
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	23
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	66
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	765
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	11
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTT 	2
----------------------------------------------------------------------AGTTAACTGTACAACCTTCTAGCT 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	6
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
3 Mus musculus GSM539868 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	8
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	20
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	37
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	5
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	9
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	23
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	1
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	350
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	674
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	30294
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	85541
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	16364
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2429
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	17394
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	121
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	537
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	52
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	9
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	3
--------------------------------------------------------------------------AACTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
4 Mus musculus GSM539877-5198 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	8
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	5
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	11
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	9
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	8
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	3
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	169
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	105
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4296
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	16295
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	3370
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1128
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1956
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	6
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	50
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	7


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
5 Mus musculus GSM539838 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	7
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	725
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	3262
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	65200
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	122056
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	27712
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	4702
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1044
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	29
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	65
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	170
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	20
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	6
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	3
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	2
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
6 Mus musculus GSM539850 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	14
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	10
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	15
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	33
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	22
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	99
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1828
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	65474
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	230368
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	33102
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	11417
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	8754
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	7
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	13
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	738
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3842
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	213
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	1
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	435
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	13
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	3
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	6
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTAA 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
7 Mus musculus GSM539835 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	55
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	54
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	23
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	5
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2592
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	50249
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	175372
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	17524
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2896
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	12671
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	710
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	87
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	7
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	110
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	406
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	7
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	15
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	5
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	5
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
8 Mus musculus GSM527276 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----ACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGG 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	10
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	27
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	5
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	233
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	5
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	9
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	90
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	58
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	4
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	5
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	22080
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	64828
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	12616
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2071
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	205
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	204457
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1921
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	5
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	647
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	66
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	199
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	8
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	120
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	6
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	441
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4826
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	47
------------------------------------TAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTAA 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTA 	3
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTT 	6
----------------------------------------------------------------------AGTTAACTGTACAACCTTCTAGC 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	3
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	31
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTT 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTT 	1
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	4
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
9 Mus musculus GSM539869 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	3
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	24
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	19
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	6
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	38
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	161
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	171
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	21
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	103
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	217
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	37
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1162
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	4940
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	173557
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	562413
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	95316
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	11482
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	114294
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	12
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	5
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	354
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1182
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	135
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	16
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	14
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	30
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	4
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	9
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4
------------------------------------TAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTA 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTT 	1
--------------------------------------------------------------------------AACTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
10 Mus musculus GSM539870 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	2
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	19
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	16
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	3
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	17
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	23
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	109
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	149
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	16
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	49
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	168
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	14
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2709
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	9820
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	243073
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	684277
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	124292
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	15910
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	145132
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	18
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	362
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1288
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	123
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	20
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	12
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	25
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	8
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	5
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
11 Mus musculus GSM539849 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	15
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	25
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	2
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	36
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	741
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2604
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	135538
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	286191
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	71148
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	13646
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	33027
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	9
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	296
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1117
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	119
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	20
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	14
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	12
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	6
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	7
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3
------------------------------------TAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
12 Mus musculus GSM527277-2110 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----ACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGG 	3
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	87
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	9
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	27
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	5
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	152
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	22
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	433
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	10
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	89
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	31647
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	375276
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	22
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	151716
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	4
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	48950
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	4973
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	475
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	691
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	5801
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	322
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2545
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	16
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	257
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	34
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	23
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1469
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	12
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	13833
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	177
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
------------------------------------TAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGT 	1
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTAA 	1
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGT 	4
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTT 	6
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTA 	7
------------------------------------------------------AGAGTTACACCCTGGGAGTT 	1
----------------------------------------------------------------------AGTTAACTGTACAACCTTCTAGCT 	1
-------------------------------------------------------------------------TAACTGTACAACCTTCTAGCT 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	5
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	4
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	31
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	5
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	6


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
13 Mus musculus GSM539848 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	9
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	12
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	23
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	33
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	24
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	7
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1999
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1137
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	42107
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	159229
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	11603
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1296
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	14163
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	49
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	63
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	497
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	22
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	9
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
14 Mus musculus GSM539864 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGT 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	9
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	724
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	52923
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	166712
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	35193
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	15946
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	9213
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	434
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	30
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	141
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	29
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	71
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	453
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	3
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	9
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	13
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
15 Mus musculus GSM539872 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	95
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	114
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	17
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	156
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	12
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	44
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2627
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	4214
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	182450
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	568767
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	97220
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	13520
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	114091
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	91
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	8
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1587
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	162
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	38
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	6
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	431
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	27
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	42
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	12
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	6
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTAA 	1
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTA 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
16 Mus musculus GSM539861 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	9
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	51
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	359
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	13409
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	103515
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	17277
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	6519
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	11996
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	177
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1464
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	181
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	83
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	4
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	7
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	5
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	8
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
17 Mus musculus GSM539847 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	13
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	79
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3338
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	24066
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	5850
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2519
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2981
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	2
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	12
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	102
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	16
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	9
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	2
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
18 Mus musculus GSM539853 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	9
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	3
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2127
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	955
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	28972
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	105004
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	6040
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	749
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	6243
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	60
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	44
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	329
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	19
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	8
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
19 Mus musculus GSM539878 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	7
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	8
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTA 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	104
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	92
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	9
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	35
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	44
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	29
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	130
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	12057
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	5051
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	242196
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	693065
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	92647
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	10937
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	62494
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	130
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	746
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	75
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	16
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	7
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	16
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	7
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	7
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	2
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
20 Mus musculus GSM539873 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	29
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	84
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	127
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	22
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	44
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	63
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	89
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2758
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2068
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	99321
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	378271
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	52120
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	6595
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	35444
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	94
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	595
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	64
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	11
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	9
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	32
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	6
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	15
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	10
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	8
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTAA 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
21 Mus musculus GSM539875 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	23
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	21
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	10
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	3
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	106
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	726
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	22946
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	85524
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	19974
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	8500
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	4461
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	2
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	97
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	398
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	56
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	22
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	1


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
22 Mus musculus GSM539857 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTA 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	3
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	32
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	624
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2351
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	90972
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	205380
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	63268
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	24481
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	12735
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	8
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	139
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	368
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	78
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	37
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	2


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
23 Mus musculus GSM539867 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	8
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTA 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	4
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	38
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	35
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	2
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	1
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	1495
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2076
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	40933
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	334250
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	10351
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1604
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1140
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	14
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	10
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	524
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4530
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	140
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	39
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	13
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	29
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	1
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	6
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	9
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
24 Mus musculus GSM539876 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGT 	3
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	5
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	5
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	22
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	145
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	186
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	43
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	17
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	115
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2911
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	3846
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	188607
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	768737
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	164699
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	64235
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	31083
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	5
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	5
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	303
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1359
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	219
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	97
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	16
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	10
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	18
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
25 Mus musculus GSM539854 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
----------------------------GGTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	13
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	4
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	10
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	7
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	34
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	31
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	4
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	16
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	24
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	37
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2085
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	974
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	45155
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	206762
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	9435
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1455
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	26218
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	3
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	4
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	99
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	917
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	44
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	8
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	7
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
26 Mus musculus GSM527279-2112 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----ACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGT 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	1
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	13
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	8
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	5
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	1
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	4
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	76
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	201
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	39
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	11619
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	13638
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	2034
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	141
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	154584
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	3
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	57303
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	123
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	68
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	479
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1252
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	83
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	7
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	9
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	202
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	3116
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	31
------------------------------------TAGTAGGTTGTATGGTTTA 	1
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTAA 	3
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGT 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTT 	2
-----------------------------------------------------TAGAGTTACACCCTGGGAGTTA 	3
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
----------------------------------------------------------------------------CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC 	27
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTC 	1
-----------------------------------------------------------------------------TGTACAACCTTCTAGCTTTCCT 	3


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
27 Mus musculus GSM539874 TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC up 3 0


Secondary structure

AAGAAACATTGGAAGCTGTGTGCATCCGGGTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGAGTTACACCCTGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGCACACTTGAGCCATCGAGGAAT
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	2
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	17
-----------------------------GTTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	10
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	27
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	172
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	217
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	39
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTATG 	14
------------------------------TTGAGGTAGTAGGTTGTAT 	3
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	70
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2058
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	2298
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	104715
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	597046
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	105196
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATGG 	42135
-------------------------------TGAGGTAGTAGGTTGTATG 	19799
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAG 	2
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTA 	8
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	246
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	1685
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGT 	244
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGG 	101
--------------------------------GAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTAGA 	1
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	6
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGTT 	9
---------------------------------AGGTAGTAGGTTGTATGGT 	2
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTTT 	13
----------------------------------GGTAGTAGGTTGTATGGTT 	15
-----------------------------------GTAGTAGGTTGTATGGTTT 	3


Overlaps with: MNEST031755 MNEST032641
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: tgu-let-7c-2 ggo-let-7c tgu-let-7c-1 cfa-let-7c gga-let-7c rno-let-7c-1 eca-let-7c mmu-let-7c-1 cgr-let-7c ptr-let-7c mml-let-7c ppy-let-7c bta-let-7c hsa-let-7c
HuntMi prediction: true miRNA