miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: deep sequencing predictions



Please select library, species and/or miRNA sequence.


selected mature miRNA sequence: TGGTAGACTATGGAACGTAGG

selected species: Mus musculus



22 records found  

#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
1 Mus musculus GSM527274-2107 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
------------------AGATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	20
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	27
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	14719
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	7215
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	71
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	79
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	92
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAG 	23
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGGC 	1
-----------------------GTAGACTATGGAACGTAGG 	5
---------------------------------------------------------CTATGTAACATGGTCCACTAAC 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTA 	11
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	72
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	47
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	346
-----------------------------------------------------------ATGTAACATGGTCCACTAA 	1
-----------------------------------------------------------ATGTAACATGGTCCACTAAC 	6


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
2 Mus musculus GSM527280 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTA 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	6
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	2728
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	9
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	1938
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	19
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	12
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAG 	10
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	9
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	80
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTA 	5
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	24
-----------------------------------------------------------ATGTAACATGGTCCACTAAC 	1
------------------------------------------------------------TGTAACATGGTCCACTAAC 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
3 Mus musculus GSM539868 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	23
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	2


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
4 Mus musculus GSM539877-5198 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	63
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	13
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
5 Mus musculus GSM539835 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	18
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	2
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
6 Mus musculus GSM539855 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	65
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	222
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	12
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	10
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	3


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
7 Mus musculus GSM527276 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTA 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	9
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	20
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	9831
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCG 	2
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	69
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	5064
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	55
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	49
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAG 	25
-----------------------GTAGACTATGGAACGTAGG 	4
---------------------------------------------------------CTATGTAACATGGTCCACTAAC 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	37
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	243
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTA 	12
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	40
-----------------------------------------------------------ATGTAACATGGTCCACTAAC 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
8 Mus musculus GSM539869 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	9
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTT 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	75
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	2109
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	289
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCGT 	2
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCG 	3
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	130
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	4
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	3
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	9
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
9 Mus musculus GSM539870 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	56
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	7
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	6


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
10 Mus musculus GSM527277-2110 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
GTTCCATGGTTCCTGAAGAGA 	1
-------------------GATGGTAGACTATGGAACGTAG 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTA 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGT 	2
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	20
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	24
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	75
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	11831
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	90
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	8294
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAG 	71
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	130
-----------------------GTAGACTATGGAACGTAGG 	6
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTA 	21
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	64
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	57
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	316


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
11 Mus musculus GSM539848 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	2
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	12
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
12 Mus musculus GSM539872 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	28
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	5
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	3
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	2


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
13 Mus musculus GSM539871 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	22
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	3


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
14 Mus musculus GSM539878 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	2
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	12
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	294
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	36
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	3
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	2
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
15 Mus musculus GSM539873 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	21
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	435
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	51
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	6
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCGT 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	2
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
16 Mus musculus GSM539875 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	33
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	467
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	60
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	6
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGGC 	1
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	4
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
17 Mus musculus GSM539857 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	8


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
18 Mus musculus GSM539867 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
GTTCCATGGTTCCTGAAGAGA 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	34
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCGT 	2
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	731
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	2164
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	134
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	13
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCG 	4
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGGC 	2
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	4
------------------------TAGACTATGGAACGTAGGC 	1
-------------------------AGACTATGGAACGTAGGCG 	1
---------------------------------------------------TTTGACCTATGTAACATGGTCC 	1
---------------------------------------------------------CTATGTAACATGGTCCACTAAC 	2
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTA 	3
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACTC 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	3
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	67
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	22
-----------------------------------------------------------ATGTAACATGGTCCACTAACT 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
19 Mus musculus GSM539876 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	3
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	27
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	514
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	55
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCGT 	1
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	5
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	1


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
20 Mus musculus GSM539854 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	4
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGT 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	72
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	823
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	81
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	34
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	11
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACTC 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	16


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
21 Mus musculus GSM527279-2112 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
-TTCCATGGTTCCTGAAGAGA 	2
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGT 	2
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	19
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	33
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	16877
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	10204
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	111
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCG 	1
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	97
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	104
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAG 	31
-----------------------GTAGACTATGGAACGTAGG 	5
---------------------------------------------------------CTATGTAACATGGTCCACTAAC 	1
---------------------------------------------------------CTATGTAACATGGTCCACTAA 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTA 	23
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	55
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	106
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	675
-----------------------------------------------------------ATGTAACATGGTCCACTAAC 	6


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA



#specieslibrarymiRNAmiRNA*armmismatchesbulges
22 Mus musculus GSM539874 TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC up 3 0


Secondary structure

GTTCCATGGTTCCTGAAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCGTTATGTTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCAATCCAT
-TTCCATGGTTCCTGAAGAGA 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGG 	6
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	1
--------------------ATGGTAGACTATGGAACGTAG 	3
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGC 	131
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGG 	2080
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAG 	177
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTAGGCGT 	4
---------------------TGGTAGACTATGGAACGTA 	7
----------------------GGTAGACTATGGAACGTAGG 	11
-----------------------GTAGACTATGGAACGTAGG 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTA 	1
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAACT 	6
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAAC 	15
----------------------------------------------------------TATGTAACATGGTCCACTAA 	10


Overlaps with: MNEST032051
Overlaps with miRBase pre-miRNAs: mmu-mir-379 cgr-mir-379
HuntMi prediction: true miRNA