mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTCGGTTCAGCTCGGTTAA GTTCTGAGCTCGATTAAGCTC TGAGCTCGGTTCAGCTCGGTTAACCCCTTCTCGCGATTGAACCCAGTTAACTTGTAAAAAGTAATGGACAAGCTCGGAACTCCTTTCGAGTTCGGCTAGCTTTCACTTCATTTTTTACCAAGTGTAACTGGACTGAAGCGAACGAAGGTTGTTCTGAGCTCGATTAAGCTC TGAGCTCGGTTCAGCTCGGTTAACCCCTTCTCGCGATTGAACCCAGTTAACTTGTAAAAAGTAATGGACAAGCTCGGAACTCCTTTCGAGTTCGGCTAGCTTTCACTTCATTTTTTACCAAGTGTAACTGGACTGAAGCGAACGAAGGTTGTTCTGAGCTCGATTAAGCTCGGTTAACCCCTTCTCGCGATTGAACCCAGTTAACTTGTAAAAAAGTAATGGACAAGCTCGGAACTCCTTTCGAGTTCGGCTAAGCTTTTCCTTCATTTTTTACCAAAGTGGAACTGGATTGAAC 3 1 5' arm Actinidia_deliciosa mirnest 100 100 -55.1 .(((((.((((.(((((((.(((((..(((((((..(((...((((((((((((((((((((....((.(((((..((((((.....))))))....))))))).....)))))))).))))).)))))))..))).))))..))))))))..))))))).)))).))))) (-55.1)