mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTCTGTAAAGAAATAAAA ATATTTGTTTATGGAGGGAGT CTAATGGATATTAGTTAGTACTCCCTCTGTAAAGAAATAAAAGAGCGTTTAGATCACTAAAAAGTAGTTATCTAAATAATCTTATATTTGTTTATGGAGGGAGTATCTAGTTATATGAGAGT CCCGGGCTGCAGGAATTCGGCACGAGGGTTGGCCCTGAACTTTGTAAGTCATCCTAATGGATATTAGTTAGTACTCCCTCTGTAAAGAAATAAAAGAGCGTTTAGATCACTAAAAAGTAGTTATCTAAATAATCTTATATTTGTTTATGGAGGGAGTATCTAGTTATATGAGAGTATTGTTCAGCTATACTCATTAGCTGCAATGGATCTTGTTAATGTAGCTTGCAGATGTGTGGTCTTGTGGGGTGACTCTTTACGTCATGCTTGTGGGAGGCTACCCATTTGAAGACCAGGATGACCCCAAGAATATACGCAAGACCATTCAGCGAATAATGTCTGTGCAATACACTATACCTGATCATGTCCACATATCCACGGAATGCAGACAGCTTATGGCCAGTATCTTTGTTAACGTCCCATCGAAGAGAATCACGATGAGGGAAATAAAGAGCCACCCGTGGTTCTTGAAGAACCTGCCAAGGGAGCTCACTGAGACGGCGCAGGGCATGTACTACAGGAGGGATAACGCCGTGCCTTCTTTCTCGGAGCAGACCTCAGAGGAAATCATGAAGATTGTCCAGGAGGCAAGGACCATGCCGAAGTCATCCAGGCCAAGCTATGGTTGGGGCGACGACGGTTCAGATGACGAGGAAGAGAAGGAAGGGAAGACCGACCANAAAANAGGGANGANGANGANGACNANNTACGACAGAGGGTCAAAGAGGTCCATGCAAGCGGAGAGCCTCGCATGAGCTCGCTACGCATATCATGAAAGTATGCGGAGTTAGTTACCTGTAGATAATCGGGCTATCGTGGGAACTGTGCGCTCAANTGGGTAAATGCATTTTTGCTGAAGTTTGCTTCTCCTTGGNTTTGGGTCCCTGTACCCGTATTACATGGGACAAAG 2 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 8e-21 tae-MIR1121 0.00000000000003 -43.2 ((.(((...(((((...((((((((((((((((.(((((.((((..((((((((.((((.....)))).))))))))..)))).))))).)))))))))))))))))))))..))).))... (-43.2)