mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTCTGTAAAGAAACATAA ATATTTCTTTATGGAGGGACT TCAGTCTTAATTAGGTAGTACTCCCTCTGTAAAGAAACATAAGAGCGTTAGATCAAGAAAGTAGTGATTTAAATGCTCTTATATTTCTTTATGGAGGGACTACCAGCCTACTGCGCCAC ATCTTCTCTGCTGTTGCTGCCTGCTCCAAGACTGCTGCGGCCCTTTCTTCGGACACCCGGGCCCAGGCGGTCCACCGCCCCATTTCTGATAGTATGCCGAGCCGGGGACCTTCTCTACGGTGACAAACTATTCCTGGGCTAAATATATTCGCTGAAGAACCCACTTGGGTGAAGCTGCTGCATATTTGAAGTTTCCCTTGCTACTGTACTATGTAAAAACTAGCAAAAATAATGGTCTTGACATCACTCTGTTGGTGATCATTGTTTCAGTCTTAATTAGGTAGTACTCCCTCTGTAAAGAAACATAAGAGCGTTAGATCAAGAAAGTAGTGATTTAAATGCTCTTATATTTCTTTATGGAGGGACTACCAGCCTACTGCGCCACATTAAGTCCTGGGTTGTTTCTTTGAATCTTAATTACGCCATTTAATCTTGCACTGTATGTACACTTGCTTGGCATCGGATGAGCATTACTGATCTTCTGCTGGAACTTACTATGGGGAAGCGCCTTTGCTGGATCAACGAGAAGCAGAGATTACTGTGTTTATGGGAGGCCGTTAACATTTTCTCTGGGGGGGGGCCGGGACCCATGTTGTCGCCTATCGGGGGTTTTGTTATCACTGCATCGAGCCGTCGTTGAACTACAGTTGTATTGGGAAGATACCGTGGAGTACAGATCAAGGCGTGCGTGAGGGGAATCACCTTGTCGTGAGAGGGGGAAGGATGTGAGAGCGGCAATGGGCCAGTCTTCTGCCAGCCCTAGCCCCCCATATTTTACCATAGAAGCATCGAAGTGATATTTCGAGTTGAGT 1 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 3e-17 tae-MIR1121 0.000000000000002 -46.9 ...........(((((.(((.((((((((((((((((.((((((((.((((((((.........))))))))..)))))))).)))))))))))))))).)))..)))))......... (-46.9)