mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT TCCCCGCCCGTCCGTCGCCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCTCCGCCCGCCCCGACGGGCCGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCGACCACCACCACC CGGCACGAGGGCCGTAGGTAGCACGCCCCCCCTCCCCACCCGCAAAGTCCACCGCCGGCCCGCCGGATCGGGATCGGTCGACCGATCGTCTCCTCCTCCCCGCCCGTCCGTCGCCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCTCCGCCCGCCCCGACGGGCCGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCGACCACCACCACCGCTTTCGCTCCCTCCCCGCGCCCTCCCGAATTGGTCGGTGCTCTGGCACCTGCCTGGTTCGATCGGTCCGAGGCTGGTGGCTGATTGCTGCTGCTCGCTGCCGATTTCTATGCGCGATCCCGTTTTTTGCCCGAGGCGTCCTGATGTTTGCCTGGATTAGGAAATTCGCTAGATCCAGATCCGGCGCCCACCTTTAATTGTTGTTGCTTGTGCGATCTAACGGAATTCGGCGAT 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR168 4e-35 hvu-MIR168 2e-55 -59.2 .............((((((((((.(((.((.(((((((((((((..(((((...((((((((......)))).)))))))))..))))))))))))).)).))).)))))..))))).......... (-59.2)