mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCTTCCGTCCCAAAAT TTCGGGGTCGAGGGAGTACTT TAGCTAATTATATACTCCTTCCGTCCCAAAATAAGTGAATCAAAAATGACTTAGTTTTTACTAAATTTAGTATAAAGTTAAGTCACTTTTGATTCACATATTTCGGGGTCGAGGGAGTACTTCATAGCAA AGACAACATAATGATAGAAGCGTTTGCTGAGGAAAATAATATGGTGTTCCTGTCGACATTGAACAACATCTATGCGCTCCATCTTCAGTCATTGGAGTTGAAAAAAATACCCAAAACCGACAGCGGATCTCGGTACCATCCATACGAAAGTGTCTATAATGCAGATGTTGGCGGGGAACATGGTCGAGCTGAACTTTTTGCACAATGCATAGGATGACCGGCTGGTCTGATACGCTATCATGATGTATTGGTTGATCAGGAGCTTTAGGCTCAAGGAGTTGGAAGAAGGGAACGCTTCATCTTTGTAGCTAATTATATACTCCTTCCGTCCCAAAATAAGTGAATCAAAAATGACTTAGTTTTTACTAAATTTAGTATAAAGTTAAGTCACTTTTGATTCACATATTTCGGGGTCGAGGGAGTACTTCATAGCAACAATTTTGTAATTGTTCTAAATTCCTGGATGATGTAAACTATGGCATGATTGTAATATATATAATATACTCATTTTGGTCATCAT 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 0.000000000008 osa-MIR1862c 0.0004 -49.9 ..((((......(((((((((.(((((.(((((.(((((((((((.(((((((((((.(((((....))))).))).)))))))).))))))))))).))))).))))).))))))))).....)))).. (-49.9)