mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCTTTC AGGGAGTGGCGGAGGTGGAT GTACGGAGGAGAAGGGAGTGGCGGAGGTGGATCAAGCGGCGGGAGCTATACTACTTCAGGGCAGGGTTATGGTGTGAATTATCCGCCTCATCAACTGTTTCAGTATTCTCCGATTGCTTCAACCGGTGGCTATGCTCAGCACTATGCAACTCCCATGTCCCTTGCTCCTTCCCCTGCCTTGCAATCAGTGTGTTTTGCTGTGCCGCAGGCGTGACAATGGCTCTTCAAGCTCCAATTCCTCACCGCTAGAGACTTATAAAATGAAACACTAAGCTATGTCATCCCATCATCATCACTTATTGCATGCATGCTTCTTCAAGTCTCTCATCATCATCATCATCATCTTTCTACCTTTTG CCCTACAGCCGGGGCAGCAGCGGCGGCGGCAGCAGCCACCGCGTTTTATCCGTATATGCAGTACGGAGGAGAAGGGAGTGGCGGAGGTGGATCAAGCGGCGGGAGCTATACTACTTCAGGGCAGGGTTATGGTGTGAATTATCCGCCTCATCAACTGTTTCAGTATTCTCCGATTGCTTCAACCGGTGGCTATGCTCAGCACTATGCAACTCCCATGTCCCTTGCTCCTTCCCCTGCCTTGCAATCAGTGTGTTTTGCTGTGCCGCAGGCGTGACAATGGCTCTTCAAGCTCCAATTCCTCACCGCTAGAGACTTATAAAATGAAACACTAAGCTATGTCATCCCATCATCATCACTTATTGCATGCATGCTTCTTCAAGTCTCTCATCATCATCATCATCATCTTTCTACCTTTTGGCCTAACCATGGTGCTCTCTTTCACACACACGCACTCTTCCACACTAACACAAAACAAAAGTCCATCAATGGCATTTGGGCTTTTGCATAAGATGCCCCCCGTAGGGGCTCAAAAAGTTACTCCTTGCATATGAAAAA 3 1 3' arm Arachis_duranensis mirnest 100 100 -77.1 ....((((((((((((.((((.((.(((((.....((((((..(((.((((.(((.((((((((((..(((((((((..((.(((((.........(((..((((.((...)).))))..))).))))).))...))).))))))((((............))))......)))))))))).....)))))))...))).)))))).(((((((.(((((((.....))))...)))..))).))))((((((((.......(((.((....((.((((.((................)).)))))).)).)))...))))))))..))))).)).))))..))))))).))))).. (-77.1)