mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCAAAATAA ATTTTGGGACGGAGGGAGTAT GTCAACTGTGGTTACTGTATATGGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTCTCTTAAGCTTAGTATAACTTTGTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGATACAGTTATTTTGGGACGGAGGGAGTAT AATACAGTACATTTTTTTAGAGAACCTAATCACAGTACATCAATGTGAAGCAAGCGATTTTCTTCAGAATTCGAGATTCATTGCGCAGGACTCTGCTAAGTAACAGAGTTCTGTTTCCCTCTAAAGATATTAAGTTTGAAGCAAGATGTTAACTTTTCAACACCCTAATAAAATGTGTCTGATGTCATTTCCAACAGGATTGTGCTACTAACAACAATGTCGTATTTCCGTTTTTAATTTTATTTTCTGGTTATGATAAAATGTGTTTGATGTCATTTCCTACCTTGGGTTTTGCTCTTCAGTTACTGCCATTTCCACAGACCTATATCTGCCTTGTTTTGTTTCTCCTATGTGTGTGAGTCTGTTTATCACATTTGTACGCACAGTCAACTGTGGTTACTGTATATGGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTCTCTTAAGCTTAGTATAACTTTGTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGATACAGTTATTTTGGGACGGAGGGAGTAT 0 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 1e-32 osa-MIR1862c 0.000002 -49.9 ....((((((.........))))))(((((((((((((((((((((((.......))...((((((((((((((((....)))))))))))).))))..))))))))))))))))))))).. (-49.9)