mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCGTCCCAAAATAAGTGT ACTTATTTTGCGACGGAGGGA CCTTAACATGCTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGTACTAAGCTTGAGACACTTATTTTGCGACGGAGGGAGTATTGTTTTATT GTGATTGTGAAGCTGTCAGATGAGATCTCGTCAACTGATGACACAAACATGAAAATATGCGACATCTTCAGGGGGTACCCTTCTGTGAAATGCAATGTTTATCTTAGCTCTGGTAAGTATATGTTTTACATGCTCTTAGATGCAACAAGAATATAAAGTCCAACTGTCATGATTTTCATCTTGTGCAAAATCTCTATAGTTATTGCAATGTGCCGTTTACATGCCAATTATAATGTCTGGCTGTACATGTATCCAGTTATCACCTTAACATGCTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGTACTAAGCTTGAGACACTTATTTTGCGACGGAGGGAGTATTGTTTTATTGATAGACAACAATATTATGTCAATGTGTGTTACAGAGAAATATATGCTTTCTTACTGCTGAATTTGTGTGCACATTCCCTTGTATTTTTGTAAACTGAAG 1 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 4e-38 far-MIR1122 0.000000006 -57.4 ....((((...(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((....))))))))))).((.....)).)))))))))))))))).))))))))))))).))))..... (-57.4)