mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACCCTCTCTCTGTCT TGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCAGGCTACGTCTGATAAGAGCATGGTTAATAGTATAGCCAACTGCTGGCTATAAGCATCTTTATAGCTCATCTTATAGCTGGCTTGTACAATAGTTAGCTGTAAAAGAGTACTACTTTTATCATATATGGCCTACCTTTCATTCTCACAAAGCACCTATGAGCACGTGCTAGAGCCGGCTCTTCACGAAGAGCCCGCTTCCCTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCATCCAACTCAGCAAANATATAGTATTTTAATCCTTACAGCCTGCTGACTGTACCTTATTGTACTTGCTCTAAAGAGGACGGATGGATGCGAAGAGAGAGAGAGATAGACGCAGCTGCTGTTGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCT TTGAAGAAGAAGACAAGAGGATAGCCCTCCCAGATCTGGCCTGCCGCCGGACCGACTGGCGCCGTGCCGACGAGGCGACGACGAAGGCGTATGCGTACATGGGTTTGATCTCGATCTCTCTCTTCGCTTCCGCCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTGCGTGTTGAACGTCTGCTGTGTTCGATGGGATCGGTCGGGGGCTACGGTGGAGGGTTGATGATGGTGTGAATGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCAGGCTACGTCTGATAAGAGCATGGTTAATAGTATAGCCAACTGCTGGCTATAAGCATCTTTATAGCTCATCTTATAGCTGGCTTGTACAATAGTTAGCTGTAAAAGAGTACTACTTTTATCATATATGGCCTACCTTTCATTCTCACAAAGCACCTATGAGCACGTGCTAGAGCCGGCTCTTCACGAAGAGCCCGCTTCCCTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCATCCAACTCAGCAAANATATAGTATTTTAATCCTTACAGCCTGCTGACTGTACCTTATTGTACTTGCTCTAAAGAGGACGGATGGATGCGAAGAGAGAGAGAGATAGACGCAGCTGCTGTTGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCT 3 1 5' arm Hordeum_vulgare mirnest mir-156 0.0000004 hvu-MIR156 2e-39 -126.9 .....((((((((((.((((((((((((((((((((((.((.(((((.((((((((.......((((((((.....)))))))).......)))).))))...((((((((((((........)))))))))))).(((((...)))))))))).)).))))))..((((...........(((((..........)))))))))..(((((((....))))))).((.((...((((((((((((((.....((((((..((((((.......((.((....)).)).......))))))((((.((((.(((.........))).)))))))).)))))).)))))).))))))))..)).)).))))))))...)))))))).)))).)))))). (-126.9)