mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCTAACGACTCTCAGGTATC TATCTGAGAGCTATTAGATGA ATTTCAATAAGGTGAAAACTCGGGTGAAGTCGACTTCACGTGAAGTTGATATCTGAGAGCTATTAGATGAAAATTTAGTCAAATCAATTAAATCATCTAACGACTCTCAGGTATCAACTTAACGTAAAATCGACTGCACCTGAGTTTCCACCTTTCAATAA GCCCGTGCAGGTACTCTCTCAAGAGTGATGGCAGAGAGATAGCATCAGGTGTAATACCAGACCCTGGTTCATTGAAGGCAAATGGGACAACATTGCTTGATGTCCCAGTTAAGGTTGCTCACAGCATATTAGTGAACTTGATTAGGGACATTGGTAGAGACTGGGACATTGATTACCAATTGGACCTTGGCTTAGTTATTGATATTCCTTGTGTTGGTAACATCACCATTCCTGTTTCTCAGAAGGGAGAGATTAAGCTTCCAACCCTCAAGGACATGTTTACTGGTGGCTCTAAGAATACTGATCCTGCTCCTGCTCCTGCTACTACCTAATAACCTACCCTTTAATTATTGTTATTATTAAAATTAGAATAAGCAAAGAAGAAACCAAATATAGTCTCCTTTATATTATACATCATATTTTCTGTTTATATCAATTTCAATAAGGTGAAAACTCGGGTGAAGTCGACTTCACGTGAAGTTGATATCTGAGAGCTATTAGATGAAAATTTAGTCAAATCAATTAAATCATCTAACGACTCTCAGGTATCAACTTAACGTAAAATCGACTGCACCTGAGTTTCCACCTTTCAATAANT 3 0 3' arm Arachis_hypogaea mirnest 100 ahy-MIR3509 7e-37 -71 ........((((((.(((((((((((.((((((.((.((((.(((((((((((((((((...((((((((...((((((.......))))))))))))))...))))))))))))))))).)))).)).)))))).))))))))))).))))))....... (-71)