mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCTAACGACTCTTAGATATC TATTTGATAGCCATTAGATGA ACCTGTCAACAGGTTAATGTATACTTAATTGAATTGTTTAATGGTGAAAATTTCAGGTGCAATCGACTTCACATGAAGTTGATATTTGATAGCCATTAGATGATTTGACTGATTTAACTAAATTTTTATCTAACGACTCTTAGATATCAACTTCACGTGAAGTCGATTTCACGTGAGTTTTCATCTTGTTTAATACATTTGATAAGTTAAAATATATTGAAAAGAGT CTTTGGAGTCAAGCAGATCATAAACTTTGCCAAACAATGTAGCAAACTGAAAGTGCTGGTCCACCTGTCAACAGGTTAATGTATACTTAATTGAATTGTTTAATGGTGAAAATTTCAGGTGCAATCGACTTCACATGAAGTTGATATTTGATAGCCATTAGATGATTTGACTGATTTAACTAAATTTTTATCTAACGACTCTTAGATATCAACTTCACGTGAAGTCGATTTCACGTGAGTTTTCATCTTGTTTAATACATTTGATAAGTTAAAATATATTGAAAAGAGTAGTAAGTAAGCACAATACTCTTTAGAAAATGACATGTTATATGCATTTAAAAAAAAAGGAATACAACACTTTAAAAAATATGCTATTATAGGTAAAAAATAGATAAATCAATAGGTTTTGGGTTTTTAATTTTTATAATCTTAAAAAAAAAAGTTAATATAATTAGTAAGTTATTTTTTAAATTTGAACCATGGACAATAAAATATAATTAACAAAAAACTATAATTTGTATAATTAATAAAAGTTACAACAATTTTTTTAATTTTAATACTTTTATTATTTTCTTGATACGTGCCTTACATAACGATTGTGGCTCCTTAATCTCAGCTTATGTATGCGGTG 4 0 3' arm Arachis_hypogaea mirnest 100 ahy-MIR3509 2e-29 -67.3 (((((....)))))(((((((((((((.((((((...((((.((((((((((.((.(((.((((((((((((.((((((((((((((((.((...((((((((.......(((((....))))).))))))))...)).)))))))))))))))).)))))))))))).))).))))))))))))....))))...)))))))))))....))))))))........ (-67.3)