mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCTAAAATAA ATTTTGGGAGGGAGGGAGTAC GGTTGGTACTCCCTCCGTCCTAAAATAAGTGTCTTACGGTTAGTACAATTNTATACTAGAGCTAGTATAAAGTTGAGACAGTTATTTTGGGAGGGAGGGAGTACTTTG GGATAGTTGGGGTCGGCATGATGGGGAGGGAGCACCTCCACAACCTCGCCCACCTCGCCGGAGAAGTCGAATGGGAGCAGTCCGTCCGCGTCTGCGTCACCTGCCTCGCCGACCCCCATCCGGAGTCCCTCCTCCTTGGTCTCCGTCTCGCCGCAGAGCTTGGCCTGCCACCTCCCCAGGTACTTGCCACAGCCTCCAGTCACACGCATATGATAGTACATNNTNNATAACCGCTGCCTTGCTGGTCGTAGATGTAGAGCCAGTCATACACAATCTGCTAGATTCGGTTGTCTACCGTGGGTTGGTACTCCCTCCGTCCTAAAATAAGTGTCTTACGGTTAGTACAATTNTATACTAGAGCTAGTATAAAGTTGAGACAGTTATTTTGGGAGGGAGGGAGTACTTTGATTCTAACTATATCTGGTTGGAAATATTAGGTGCATGGCAACAATGTTAAAAACACCAGCTGTTCCACGAATCCTTANACGGCAGATGATAAACTATCACCGCGAGTTGCTGGACAGCGGACTCTGTGACGCCGTTGGTGTGTCGTCGCCAACATGACACACTCTGAGATACTCATGGACATCATTGGGTATGCCCAGCCGCACCACGGTTCTTGTTGAGAAGCCTCTGTGCACACGGGTCAGGACTGTGGAAAGGGCTTAGAAGCTGTCCAACAGAGACCGGGCATACTCGGGCAGGTCGGGTTTAAAAAATACCCGGGGTTTATGCCCTCTCCGGTGGCCCTAAACCGGTTAAATCCTGGTTAAAACGGGCCCTTGGGCGGGGATAAGGGGGTTTCCCGAAACCGCTTTCCTTTTTTGTGTTCTCACAGGGGGCGCGCGTGGAAGGACCCACTCCTCTTTTTTTAAATATGTGTGGAAGAACCACCCGTGGGCTGGGGCTGTGGTTCAT 1 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 5e-28 far-MIR1122 0.0003 -48.9 ....((((((((((((.(((((((((((.((((((((.....)))(((((.(((((((....))))))).)))))))))).))))))))))).))))))))))))... (-48.9)