mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGGGTGATATTGACAGAAG TCTGAAGTGTCCCCGGAAA TATTTCTGCCTGCTGGGTGATATTGACAGAAGTGTTCTTCCTCCACTTCTGAAGTGTCCCCGGAAAAGAATCCC GAGGGTTAGGAGCCTCACACACTCCACACTTTTCAGTCCCAGTCCCTTTATACTGAGCAGAAACTCCCTGTATTGAGAAATGAATATTTATCATACACATATGTTTGCTGATATGTAATTCATCTCACACTTTGTGGTTTCTAAACCACAAAGTGGAGATATGGTAAAAAACATTTGAATGATGTATTTTCTTTTAGTTCAGTAGGTGTATTTTCTTTTTATAGAGTAGTTTATTTACTGCTGGCCTTACTTTGCTTTGTCCGGGGGCGACGTCTCTCAGCCACTCTAGGTCAATATCACCGTGATCTTCAACCAGCCGATTCAGGAAGAGCTGCACAGTGAATCATATTATGAGAAGCAATTCAACAGAAAGGAAAAAATGATATTTCATTTTGTGGAAGTTCAACTGGTACCTGAATGCGTTCCAGCGAGCCTGTTGTTCATGCCCCTTTTCTTTGATCACCATCCTGAGATTGTGCTAACATCTGCACATCTCACAGCATCCCAGTCGAGAGAATCCATGGTGTTCCATGTCTTCTCTCTCTTCCCTGCTATAGCTTGCGCGGCTGTTCGCAAGCTATCCCAGTTGATTTCGTCCTTTTGCTCTTTTCCTTTGCCCTTGCTGTCTTTTTTTGCTGAACTTGTCTCTCGGGGCCTCATTGCTTGCTTCACTTTTGTGGGCACCAGCAGTTGGCTGTGCTGGAGCCACAATCCTTTGAGAGTGAGAACTTTGAGACATTTCAGCTCCGTTGTCTGGGCAGCAAGGCATGCTCTTTTCATTTTCTGAGCTGAGGACGGAATTCCTGGGTTGGGAAGTGGATGCTCTGAGAGGGGAACATGAGTATATTTCTTTGGGGGCTGCCAATTCTTTCAAGTTCCCCAGATGGTGAGCCTTCCTCAGTTGCTTCATCCTCTTTTTGTGGTCAGCTTCTTCCTGGAACCTTGGTTGAAATATTTCTGCCTGCTGGGTGATATTGACAGAAGTGTTCTTCCTCCACTTCTGAAGTGTCCCCGGAAAAGAATCCCATCTTCTCATCGATTCTGCCATTTGAAGCTTCCCCAGTTGGAAAACCGAAGCTTCGGATGCACCATATCATTAATCCCGTTCTCTTGAGTCAATTTCTGGAACACTCCACTGGGTTATCTTGGTCCGACTGTCCATGGCGCTTGAACGGAGTGATTGACGGAGCAGATTCCCCCCCTGA 2 2 5' arm Arachis_hypogaea mirnest 100 ahy-MIR3516 4e-24 -23.7 ...((((.....(((((.((((((..((((((((.........)))))))).)))))))))))...)))).... (-23.7)