mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTAAACTAATATAAGAG CTTATATTAGTTTACGGAGGG CATTGTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAGCATTTAGAACACTCTTATATTAGTTTACGGAGGGAGTACTCA CTACGAGTTCGTCATGGATCAGGCGCAATCCGAGCTCCAATCTCCAATATTTGTTGAGCTGGGGAAAGCAGTGGACGGAAAGAAATGTATCATATGTGAAGCGGTTAACTCAGAGTTCAACGAAATTGTTTCAATGTGTGGCGGGCCAGAGGAGAAAACCAGAGCAAATCAATTACTGAAACAACTTATAATTGACCCAGACAGTCCTTCACCACGTATGATGGATCTTCCAACAACAAGGAAGCTTGCCATGAAGAACAAGGTTGTTTTTGGTACAGGTGACCACTGGCGTGCTCCCACTTTGACTGCTAACATGGGGTTCGTAAGAGCTGTTTCACAGTCTGGTATGCCTTTGTTGACCATCGAGCACAGACCGCGTGCCCTTATCGGCTTGTGAAGGCAGACAACACGACAGATAATAAGTCATAATGGATATCTCATGTCTCTGTACATAACATTGTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAGCATTTAGAACACTCTTATATTAGTTTACGGAGGGAGTACTCACTAGCTAGTAAAATCGATAGTACTGAAACAGCGATGTGTATGTATTACTTTAGTTTGCTGGTTCATCAAAACGTCATGTGACATAACTCGGTAATTGATTCGGTTTAGCGTCAAGGGGGATTAAATGGCTCAAGAAAAGATCCCCCTCACCCCTTTGGAACACATTTGGAAGAGGATTACTTCAGTTTGCTGGTTC 0 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 0.000000000001 tae-MIR1121 0.0000002 -42.3 ....((((((((((((((((((((((((((((...........))))))))))))))))))))))))))))... (-42.3)