mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGGTCATCTGTGACGGGCTC GCCCGTCACAGATGACACTCT ATCACAGATGAGGGTCATCTGTGACGGGCTCCAACTAGAGGCCCATTTGAAATAAGTTTAGTGCCCGTCACAGATGACACTCTTTTTTGA TGGGAGTTCTAGGCATTGAACGCGCGTGCTACACCATGCTCGAGCTTCCGCCAAAGTGATCGATATAATCAGACTGGAATTTGCGGGCTGTCACAAGGAAGTAATCTTATTCGGGCCAAAGTTTCGCCCGATTGAGATATGGTCGCACAGCCATGGTATATCGGCATAAAACTAAAGCCCGTCACGGATGACACTTATCTGTGACGGGCTATAGTTGAGACCCGATTGAGATGACGGTTCCATATCTTAATCCGGCCTAAAAGAACCCTATCACAGATGAGGGTCATCTGTGACGGGCTCCAACTAGAGGCCCATTTGAAATAAGTTTAGTGCCCGTCACAGATGACACTCTTTTTTGACGGGCTTTTATTAAAGCCCCGATAGAAATTACTTGTTTGCCCGGCATGGTTGATTGTTTTAGGGCCGTTACAGATATTTGGTCCCCCGGTATAAACTTCCCCCCCCCACCTATTGTAACTGTATCCCCATGTTCACTTTTTATGTTGGGAGGCTGTAGGGGGTGATTTTTTTTCCTTTTTCCCACGAAATCACAAATTAAGTTCCCAAAAGTGATCATAATGGATCAATCAAATTAATTATTTTAATCATTTAATTGGGCCATTTTCATCACCTTCTTACCTTTTGCAAATACTCATCTTATAATATGTGCCCTCTAATTGCGGTCTCTTTTATCCCTGTACCCCAACTTGAACCGAAGTTCCGAATTTTTTTCCAACAGATTTTAAACCTCCAATTTTACCGGTGTTCCAGAAAACGGGTGTATTAAAATCCTTAATTAACGCCCCGCTGGGGGGACG 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest 100 osa-MIR817 0.00000007 -37.4 .(((.(((.(((.((((((((((((((((....((((((.................)))))))))))))))))))))).))).))).))) (-37.4)