mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTCCCATAATAT ATTGTGGGACGGTGGGAGTAC CCTGGAGTCAGAAATGGTTACACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGATCGTTTTTCAAGCTATGTTAGCTTGAGAAACGATCTTATATTGTGGGACGGTGGGAGTACTATCTATCTATCAAGAGT ATGCGGTCAGAAAAACCTATACTTCAGAATAATACAAAAGAAAAGCGATCTACATATATCACGCCTGGAGTCAGAAATGGTTACACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGATCGTTTTTCAAGCTATGTTAGCTTGAGAAACGATCTTATATTGTGGGACGGTGGGAGTACTATCTATCTATCAAGAGTTCAAGAGTCAAGACTCAAAACTTTAGACACTAACTCAGAAATAACAACTCTGAAAGGTAAGCTCATGTACAACAAACAACAGATGGAAGTAAATCACAGTTCATCATAAATGGGAGGAGCATTTGTTTGG 1 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 5e-22 tae-MIR1120 0.0000004 -64.7 ..((((...(((..((((...((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))........ (-64.7)