mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGTAGAAAATGAACGGTAT ACATTTCATTTTCTATACTCA GAGAATCAATAATGTTATTTCTACATTTCATTTTCTATACTCATTCTCTGCACCTTCCTTTTATGTATGATAAAGGAAAAAATATAAATTTTTCTATTATTTTGTCATAAAAGTGAGGTGTAGAGTAAAAATGTAGAAAATGAACGGTATAAATAACATTGATGTTGAG GCTTCTTTGGATTTTGCTTCCAAGTTCCTAGCAGCTACTGCATTACTATTACTGCCGTTTCCCTTAGTTTCTCACAAAGGAATTTGTTGAAAAATTTGGAGGAGAATCAATAATGTTATTTCTACATTTCATTTTCTATACTCATTCTCTGCACCTTCCTTTTATGTATGATAAAGGAAAAAATATAAATTTTTCTATTATTTTGTCATAAAAGTGAGGTGTAGAGTAAAAATGTAGAAAATGAACGGTATAAATAACATTGATGTTGAGAATGTATATTTGGTCTTTTTATCACAAATATCATAAGTTATGATTACCACAAATTAAAGCCAACTATTGGGTTTGAAAAATTATATATAGGCTTCTCTCCAAGAAATTTGGGGTAAGTATGTATATGTTCTTCTTTAGTTCTTTCAATCTCTCTAGAAATTTTTTTTCTTTATGAACTTTCTCATGGTTATTTATAGGCAAATTCCAGGCNTCACTATATAACCCCGTTTTGAGCACCTGTTTTTCTTTAGGTAATGAGTCTGTATTGGAACTGT 5 0 3' arm Arachis_hypogaea mirnest 100 ahy-MIR3515 6e-93 -58.5 .....(((((((((((((((.(((..(((((((((((((......(((((((((((.((((((((...(((((.(((((((.......))))))).)))))....)))))))).)))))))))))......)))))))))))))..))).))))))))))...))))). (-58.5)