mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCTCTCCGTCCCATAATAT ATTATTGGGCGGATGGGGTGG TTCCATCTTTGTAATGTACTGATACTCTCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTCGACGGTGCTGAAACGCTCTTATATTATTGGGCGGATGGGGTGGTATAATGTGATGCCAGACGA CGGCACGAGGGTGAGTAGGAGCTCCGTGTTGGTGGTTAGCGACAGCGACAGCGCCAGCGCCAGCGCCAGCACCAGCACCCGGCAGCAGAGGTACTGAACTAGTAGTACCCTGGCTAATAGCTAATCCCGTTCTTCAGAAACCCAGGGCTTCTTTTAGGTGTGCAGCTGACTGTTTCACCTGTCATGAATAATCTAACCACTAAAGCACACCCTCTCGCTAGTTGCTGCTGCGATCAATCATCAGAGGTCGTTACAGCATGTTTCCATCTTTGTAATGTACTGATACTCTCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTCGACGGTGCTGAAACGCTCTTATATTATTGGGCGGATGGGGTGGTATAATGTGATGCCAGACGACCTATGATGATGGTTTTTCACTTTCTTGCCATGCGCTGCTAACATGTTTTGGGTCATCATGTTTTCGCAGGACTCGATGAGGTTTGTGCAG 2 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 0.00000003 tae-MIR1120 0.00002 -46.2 ....(((...(((...))).)))(((((.(((((((.((((((((((((((((((..........)))))))))))))))))).))))))).)))))(((((......)))))...... (-46.2)