mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATGTTGTCTGGCTCGAGA TCGGACCAGGCTTCATTCCCC TAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGTCTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAA AGAGAGGATGAGTTGGTGGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTCAATTTGGTTTGGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACTAACTAAACTCCATCATTATATTCTTCTTCTTCATGAGGGAGGTGGTGGCTGCTTCTGCTGCAAAGGTTAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGTCTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAACCTTTGCTATATGCTTCTGCTTGCTTTCACTTTCTTTTTAATGTTAAGTTCCTCTTTTGCAACCTCCAAGTTTTCCAAATTAATTATAATATCTTTCACTCCAACGGAAAATAAAATGAACTGGCAAGTGAGCCAAAACAATGCACATCAAGGCAGAACAAGTTGAAAGGCTCTTCTGCATCGTGAAAAGTATAGTGATTTGAAGGGAACCTGCTTACATACATTCAACTGCGAAAGAAAAAAGGCATCATTTTCATCAATCTGAATGCAATGTATTTCAGCGAAAATGGCAGTGAGGAGTATTAATTTAATTGATGATGCCCTAGTTGCTGCAGAGGCATATCTATTAAGGAAATTGATGAGTTATGAATGAAAGAAATTAAAGAAAGAGATGAGAGATAGATCAGATGTGCTGGAACGGTTAACGAGAAGAAGAAGAAGAAGCAATGGATTCTATCAATGACATAGATGTAGCAGAAGATGCATCTAAGATCACTGACTCAAGAGGTCGATGCATGATGATGCAAAACTAAACATGGAAAGA 3 0 5' arm Arachis_hypogaea mirnest mir-166 0.0000001 ptc-MIR166q 0.000000002 -34.4 ...((.((...((((((..((((((.((((((....(((((((...(((...(((.((((((.......)))))).))).))).))))))))))))).))))))..))))))...)).)).. (-34.4)