mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA ATGTGTGTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGCCGCCGCCGGCTGAGCGGAGACGGTTGCGTCGTCGTCTCCGGCGAATTTAGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCGCGGTGAATTGTT GGCCGTGGGTGACTCGCGCGCCTGTGGTCGACCTACTGGATCCAAAGAATTCGGCACGAGGAGCCTTCTCTCTCTCTAGACTTCCAGATCTGTGAAGGCGGATACGCTGTCATGACTCATGTGTGTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGCCGCCGCCGGCTGAGCGGAGACGGTTGCGTCGTCGTCTCCGGCGAATTTAGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCGCGGTGAATTGTTTGTTGTCTCTCGCCTTTTTTCGAATCTTGTAGGCGCGGCGCGAGTCAACTACGCATTGGACTCGTCTTATCTCTTAGGTTTGGATTTGCTTAATTTATAACCGTTCTGTTTATTTGTTACAGTATTTATTTGTAGAAATGAGCATGGTTTTCTCTGGATCTAAATGGCTGGTAAGCTCCGCGTTTAGTCGCTTCTCTAGATCTTGCATTTATTTATAGTCAATTTGCTTCACTGGAGATTAAAGCTGGAATTCTTATACTGTAAGTGATTTTAAAACAGGGACTTGTTTGTTC 2 0 3' arm Ipomoea_batatas mirnest MIR168 0.0000000000001 crt-MIR168 0.000000000000008 -61.2 ....(..((((.((((.((((.(((((.((((((((((.(((((.(((....((((((..((.(((.((((....)))).))))).))))))....))).))))).)))))))))).))))).)))).)))).))))..)... (-61.2)