mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCATTTACACCTGCACCTGC AGGTGCAGAAGTAACTGCAGG GAACCAAAATGTAGCCTTTGTCTGCATTTACACCTGCACCTGCACTTGCCTCAGCCCAGATCGAAAGCCTAGCTGCTGTGGTTGCGCCGCCGCATGATGGTGTATGTGCGGCCGGCCGGCCGGAAAATGATGATGGGATGAGCTGAGGTAGGTAGTAGGTGCAGAAGTAACTGCAGGTGAATGCCATTTTGGATAT CGGGGGAGGATTAAAGGTACTACTGGAACCAAAATGTAGCCTTTGTCTGCATTTACACCTGCACCTGCACTTGCCTCAGCCCAGATCGAAAGCCTAGCTGCTGTGGTTGCGCCGCCGCATGATGGTGTATGTGCGGCCGGCCGGCCGGAAAATGATGATGGGATGAGCTGAGGTAGGTAGTAGGTGCAGAAGTAACTGCAGGTGAATGCCATTTTGGATATATATATTTCAACTAATACAACTCCATACAGACATATAATATATATATCATCACGACCGGCCGGATACTATCTGGGTACGCATATATAGGTATTGTATTTCCATTTCCACCTCTCTATTCTTGCTGTATAATCTTTGCTTGGTTGCCTTTATCACCAACATAATGTCGGGTATTCAATTCGCTTAAAAAGGTAAGGTGATTCCCTTCAAAAAGTATGATAGGTATGTTTTACAAATGATGAATACCAGATTTGGGTGTTTTTGTAAGACTGATTTGGAAAATAATATAATGTGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCT 3 0 5' arm Ipomoea_batatas mirnest MIR530 0.0007 tcc-MIR530b 0.0000006 -81 ...((((((((..((.((((((((((.((((..((((((((((((((((((((((.((.........((((.......((((((.((((((((((..........)))))).))))))))))...........)))).)).)))))))))))).))))))))))..)))).)))))))))).)))))))))).... (-81)