mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATCATCATCATCTTCTTCT GAGAATGATGATGATGAACAGA TTCAATTCTCTACATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTGCTTATAACACTACCCCTCCTTTCACTGTTTCTACTTGTTCTGCCTCTGCTTCTTCCTCTGTTTCGTCTTTCTCATCTTCTGCATCTTCAAGACTTTTGTTTCCTTTTGCATTTGAAGGATGTAATAATCAACCTATCCAATTTCCTCACCAATTTAAAACAAACCCTTCTTTTCCTTATTACCGTCCAACAATACAAAATCAACAACAAATGATTTCTTTTAATCAAAGCCAGCAACAGAGCATCACTAATCCTCTGTTTTTCGCTGGAGAATCTGCATTAGCCCACCACCACCAACAACAGCAACAGCTTTTTCAATATTGGAGTGATACATTGAACTTAAGTCCAAGAGGGAGAATGATGATGATGAACAGAGCAGGCCC GGCAACAATGGAAGCCAGTTTTTGGTGAAGTTTCCATAGCAGATAGGCCTCTCAAAAAAAAAATCCGTAGCCCCGAACGTCAAGACCCAATTCAATTCTCTACATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTGCTTATAACACTACCCCTCCTTTCACTGTTTCTACTTGTTCTGCCTCTGCTTCTTCCTCTGTTTCGTCTTTCTCATCTTCTGCATCTTCAAGACTTTTGTTTCCTTTTGCATTTGAAGGATGTAATAATCAACCTATCCAATTTCCTCACCAATTTAAAACAAACCCTTCTTTTCCTTATTACCGTCCAACAATACAAAATCAACAACAAATGATTTCTTTTAATCAAAGCCAGCAACAGAGCATCACTAATCCTCTGTTTTTCGCTGGAGAATCTGCATTAGCCCACCACCACCAACAACAGCAACAGCTTTTTCAATATTGGAGTGATACATTGAACTTAAGTCCAAGAGGGAGAATGATGATGATGAACAGAGCAGGCCCGGATGGGAGGCCATTGTTTAGGCCCCCAATTCAGCCTATAAACACAACAAAACTTTACAGGGGAGTAAGACAAAGGCATTGGGGAAAATGGGTAGCTGA 3 1 5' arm Jatropha_curcas mirnest mir-598 0.000007 100 -64.593 .......((((...((((((((((((((((((((((..(((((................((((.(((.((.((((...........(((.......(((((.............((..(((((((((......((((((...(((((...(((..(((((((((((................................................)))))).)))))..)))..))))).....))))))(((((......))))).(((.((.(((((((.((.....)).))))))).)).))))))))...))))..))...............)))))....))).............)))))).))).))))..)))))..))))))))))).)))))))))))..))))....... (-64.593)