mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG TATCATGTGGCAGTTTCACC TCTCATCGTGTACCTCTAGTAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGCTTTCCTTAATACTCATCAATCCTACCCTATCCAGAGAGGAGGGATTATATCATGTGGCAGTTTCACCTGTTAATGCTAGCATGAAAA GCCATTACGGCCTACTTACGGAGGACTGTCCCCATGATAATCTCATCGTGTACCTCTAGTAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGCTTTCCTTAATACTCATCAATCCTACCCTATCCAGAGAGGAGGGATTATATCATGTGGCAGTTTCACCTGTTAATGCTAGCATGAAAATAAGAACCCTAATCGGGATAAACCATAATTTCCTGATTCTATCCAATTTTGTCAACCCATTACAGATTAATCATGGAAAAACTCTACACGATGAGCTATACTATTGTTTATATTGATTAATTGCTATTTTGTTTTCTTTCTTTTATTTCTTTTCTC 1 1 5' arm Jatropha_curcas mirnest MIR167_1 0.0000000000001 ptc-MIR167e 0.000000000000007 -37.6 .....((((((.....((((((.(((((((((((.((((((.(((.((((((((............................)))))))).))).))))))))))))))))).))))))......))))))... (-37.6)