mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGGTAATTTTATTATTTTTG AAAACGACAAGATAACCTTA TTTTATTTAAAAAAACGACAAGATAACCTTATTTTTAAGAATTTCATATTGTTTTCTTAACACACCAATTAAAATTAATAAATATTATCTTTTTTAAAAAAATAATCTTATTTATTCACCTATATTATAAAATTAATTATTGATAAAAAAAATAAAAATGAGGTAGTTTACAAATAAATGGTATTTTGATTAAAAAAAGAATTTTTATTCATTTAATTGATGTATAGAGAAAAAAACTGAAAGCCCTAAATTTAAGGGTAATTTTATTATTTTTGTTAAAAAT TCGACACTAGTGCGATCCAAANAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTAGCAATTATAAGCAGTTGGGGCGATTCTATTTAGACCCAAAAAATATCTCTCTAGCCCCAAGCTTGTTTGGGGGATAAATTTCACTGACCTCTTTTGAGATTTTTGATAAACACAATCACTTCTCCTATAATTTTTAAAATAGCACTGACCTCCATAACTTTTGAAACTATTATCAAATTTTTTTTCAAGAGCTATTTTATTTAAAAAAACGACAAGATAACCTTATTTTTAAGAATTTCATATTGTTTTCTTAACACACCAATTAAAATTAATAAATATTATCTTTTTTAAAAAAATAATCTTATTTATTCACCTATATTATAAAATTAATTATTGATAAAAAAAATAAAAATGAGGTAGTTTACAAATAAATGGTATTTTGATTAAAAAAAGAATTTTTATTCATTTAATTGATGTATAGAGAAAAAAACTGAAAGCCCTAAATTTAAGGGTAATTTTATTATTTTTGTTAAAAATTT 5 1 3' arm Actinidia_deliciosa mirnest 100 100 -39.4 (((((.....(((((.((.(((((..(((((..((((....(((((.....(((((((...(((.((((((((...((((((.(((...((((((((.((((((....((((((((....((.(((((...(((..(((((.........))))).)))...))))).))..)))))))).))))))..))))))))..))).))))))..)))))))).)))...)))))))....)))))....))))..)))))...))))).)).)))))..))))).. (-39.4)