mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAACAG TTTGGATGTGGAAGGTGGTGATGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAGGGTCTTGGTGGGTGGATTGAGCTGCTAAGCTATGGATCCCACAGTACTACCCATATATACCCCATTATGCAGTGGTAGTTCTGCGGATTCCATATCCTGGGAGCTTCATTACCTTTCCACAGATCCTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATAGCATCCTCTTTCTAATTAAC GACTACTCGTAAAAAGATAGGGTTTTCTAGGTGCCCCTTTGAGCACTTGAGTTGAGTTGGACCGGATCGGACTCTCGGAGTAGTTCTCACTTTCCATTTACAGTAGGATCGGTTTCGAATATATACTTGAGCTAGGATGAGATGAGATGCATGAGTGCTACTAGATCTATATAAGCTAATATATATGGCTCCTCCTTATATTCTAATCACAGTTTTAACTATGATAGTCAAGGTTTAACTTTTGAAGTGCCCTTGTTCTTGCTTTTGAAACTCTTGCTGCAAGCTAGTTTGTTCTTTATTTATTTGTTTGGTTTTAGTAGGGTTTGGATGTGGAAGGTGGTGATGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAGGGTCTTGGTGGGTGGATTGAGCTGCTAAGCTATGGATCCCACAGTACTACCCATATATACCCCATTATGCAGTGGTAGTTCTGCGGATTCCATATCCTGGGAGCTTCATTACCTTTCCACAGATCCTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATAGCATCCTCTTTCTAATTAACTTGTACTCTTCAATTTGTTAGATTTAGTTTTTATGTTACCTCCATCTCATTTTTGTGTGGTACAGGAACCCCATCTGGCTGCAGTGGTGCAACCGAGCTAGGTGCTGCAGCTCTATATAACGCGTTATGCGATCTCCACTATCTCTCAATCAACATTAATTAGTTTGGCTTGTAGATCCGGATCACGTATCACTTATCAGTACAGTGTTGCTCCAAATTCATTTTATTTTTTAGTTGCAGTTATTAACTAGTTGTTCGCCTTTAAACACATTTTGTTTTATTCATACATGCCGAGTAATAATTGTATGCTTTTAATCTGTTGTCTGATAAAGTGAAACCTTGATAAATTTGGGTATTGTTGTTGCCGATTAAGGCGCATTGATGTATTGATACAGTTCAATGCATATTGCATCGAATGTCCCGGAAAAAAAAAAAATAAAAAAAA 3 0 3' arm Arachis_hypogaea mirnest MIR159 1e-21 ahy-MIR159 4e-107 -82 ....(((..((((((.((((.((.((((((((((((..(((((((..(((((((((((.((((((...(((((.((.((.((((((..((.(((.((((((....((((......))))....)))))).))).))..))))))..)).)))))))..))))))..))).))))))))..)))))))..)))))))))))).)).)))).))))))..)))... (-82)