mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG ACGAGTTGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTGAGTGGGAATATCGAGCTGCTGGTCTATGGATCCCTCAAGTCCTATCTTTGTTGTTGTATAGGCTTTGTGGCTTGCATACGCCAGGAGATTCATTATCCTTTTTCTGATCCTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCTCCTCT ACACCTAACACTCTCTCTTCTCTTTTTCTAGGGTTTCCTGTGAGTAGGAAACATTAGTGAAGTTTTTGAGTAGATGAAAGGAGCTAGATTTAACGAAGTCTATGGCTCATACTTCGTTGTCTTCTTGTGTTATCTGTCTAGATGTATCAGGATTTCTTTGTTATCTCTAACTAAAAGGTTGCTTTAGGGCTTACGTCATATGCTTCTGTGAAATCCTTGCAAGAAAGATGGAAAAAAAACCCGATTGTTCTAGCTAGGGAAGTTATGTATTGCTCTAGGTGTTGTCCAGTGAAGTTTTATATTTACCAAAATCACAAATGTTTGTTTATCTCAATTTGTGCCCTTCAATATATGTGATATGATTTGCTTTCAAAAGAATAATTAAGTAGAGATTTTGTGGGTGAACGAGTTGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTGAGTGGGAATATCGAGCTGCTGGTCTATGGATCCCTCAAGTCCTATCTTTGTTGTTGTATAGGCTTTGTGGCTTGCATACGCCAGGAGATTCATTATCCTTTTTCTGATCCTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCTCCTCTTCTTTCGAGTAGAGGGTTGGATCGAGACTTTACTTTGACTAAACCTATTTGACACCCTTTTCGTATAGTTCTCACTCTTCAATGTAAAACCCATCTTAAAATTTCGGATCTTGTATTTGCCATGTTTCTTATCTTAACCAGTTCGGAAATTTTACTTTTAGACGATGTCATTTTCAGATCATATTTTTGAATGCATGGTGAGAAAATATCTG 3 0 3' arm Lactuca_saligna mirnest MIR159 0.0000000007 vvi-MIR159c 0.00000000004 -66 ..(((.....((((((((((((..(((((((.((((((((.(((.((((..((.((.((.(((((.((((((.((..((((.(((((............))))).)))).)).)).)))).))))).)).)).))..))))..))).)))))))).)))))))..)))))))))))).....))). (-66)