mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCA CGGCATCTTCAAGATTCACA CTCTTAAACCACGAAAGTCATTGATTACTGGTGCGGCATCTTCAAGATTCACATGCCAATATTCAACTCTAGATAAGTTTTTGGTCAATGGGTAATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGAAATCAATCGACTACATTCCATTTAC TACACACGACTAGGGTAGTCACTGCCTCACACGCGATCAGAAGATGCCAAACTGGTTTTGCTCCTTCTTCATCTCCTTCCGTTTCTTCTGCCCAACACAATGCCGCTCTTAAACCACGAAAGTCATTGATTACTGGTGCGGCATCTTCAAGATTCACATGCCAATATTCAACTCTAGATAAGTTTTTGGTCAATGGGTAATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGAAATCAATCGACTACATTCCATTTACTACGGTTGCGCTGAATCTTATATAGAAAGGTAAACGTTATTAATTTCCGTACGTGTGTGTTTCTGTATGCTTTATCATATTATTAATTAAGCCCATCATGATTTTTCTTATGTCTATTGTCAATATAAAGTAGCCTTGGATCGATAAAAAGTGCTATTGTTGTTCTTATGACCGATCTTTTGGTTAATTAAGTTTCTCTTGCTAATGTAATTTAATGGTGTTTTGCGGATATATGATGAGATCTTAATAGGCTC 2 0 3' arm Lactuca_saligna mirnest mir-172 0.0000001 osa-MIR172d 0.00000003 -49.4 ...............(((((((((((.(((((((((((((.(((((((((.((((((.....((((..((.....))...))))......))).))).))))))))).))))))))))))).))))))).))))............. (-49.4)