mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTCCCTCAAGGGCTTCTA GAGGCTTGCGAGTGAGATCA TTTTCCAGGCATTGATTGCTTGCTCTCCCTCAAGGGCTTCTAGCATTGACCCTACATATATGTAATGCCTCTTATTCTTATAATATAAGACTAAGAGCATGTGTTTGGAGGTCTTGCTAGAGGCTTGCGAGTGAGATCAGATACTCAATGTCTTGTTG CATCCCTAACACCATAAGATTAGAAAGAAGAAATGTAAATGAATTTTTTTCCAGGCATTGATTGCTTGCTCTCCCTCAAGGGCTTCTAGCATTGACCCTACATATATGTAATGCCTCTTATTCTTATAATATAAGACTAAGAGCATGTGTTTGGAGGTCTTGCTAGAGGCTTGCGAGTGAGATCAGATACTCAATGTCTTGTTGTTACAAGTCAAAAAAGATATGGTGACATGAAGAAATCTATGCCACACAATGTCAGCTTTATCATTAGCAACAACTTATGAATTGGCTTTTTGACCTTTTGTGTAAATGTAAGTTGAAGGTAAAATGCTTAAGCCTTAAGGTATGTTTCTTTTTTAAATGACGAATATGGATATTATTAAGCAATGATATATATAGGATATGGTAATTAATCAAGCCTAAGATTCTACCTGCCTACAATTGAAACCATTTTCAAATACAGAAATTATTGATCTACTCTGAAAACGTGAAGGTTGTTTCTTTCTCTCCATTAACTCTTATATAGATGAAGTAATGTATGTTTGGATAAAATTTTGCAGATATAATTTTATTTTTTATTTTTTCGATTGTATGGATAGAAACTGAATAATCATTTAACTTTGTCATTTCAACAAACAGTTTTTACGATAACTATCAGTTTTTATGTAAAAGAAATTTGTAGAAAAAAGAAATGACAGATAGATAACGGTTAGCCGGGTTTCCAGGCTTAAAAGTGAAAACAATAAGTTATTATGATTGT 4 0 5' arm Lactuca_saligna mirnest MIR473 0.0006 vvi-MIR447b 0.0005 -61.1 ......(((((((((.((.(((.((((.(((..((((((((((((..(((((((.((((((((......(((((.((((((...)))))).))))))))))))).))).)))).))))))))))))..))).)))).))).)).)))))))))..... (-61.1)