mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCT GAGTGACACTAAGAACACACA CCAACAAGGGCATAACTCCATAGGAGTGACACTAAGAACACACATGGTTGAATTGCTATCTCCACTGCATATTCATATGTTGTACAGTACAAATTTTCGATGCACATACAGTTGTTTGTGAGACATTGTCTACCATCCATTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTCGGAGCACCCTGTTTCCTT GGCTTCGGCGGGGATGCAACCGAAGACCCAACAAGGGCATAACTCCATAGGAGTGACACTAAGAACACACATGGTTGAATTGCTATCTCCACTGCATATTCATATGTTGTACAGTACAAATTTTCGATGCACATACAGTTGTTTGTGAGACATTGTCTACCATCCATTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTCGGAGCACCCTGTTTCCTTTCTTTCACGATGTACAACTCCAAGATGCACAAACGTTATGGGGATAGGTGTTCATCAAGGGTAAATTTATCATCAATCTCTTCACTTTCTATGTTATTGTGCTCTCTTTTCTAATACTCTTTTACCATAGGTGGAAACAATGAGCTCAAGGGTGAAAGACCCAAGCATTACGATGGAGCCATTTTCACCCTAATCCATGATGTGTTTTTTTCTGAAGAGATGGAAGGCTAAATTCTTTAAGATTATTTTTGTGAATGTTATATGATGTTAGGATGAACACATTTTGATTATTACATTGATTCCAAACAATTTATAGCATTGTCATGTTTTAGACGTTAATCTTTCGGCTATGGTATTTAAAATTGTGTTTTGTGTTTGCTATTTCAACTAAGATATTGTATTGTCAATTCATTCATCGTTACCAATTCAATAAGTGTAGGAGTTGGATTGTTAGTTGAATCAACATATTATATTCC 2 1 3' arm Lactuca_saligna mirnest MIR398 0.00004 aqc-MIR398a 0.0000006 -46.1 ..((((.(((.....((((..(((.(((((.((.((((((((.((((.((((((((..........))).))))).(((.((.(((((........((....((((.((....)).)))).)).))))).)).))))))).)))))))).))))))).)))..))))..)))))))..... (-46.1)