mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATGTTCATCATCATCGTCT ATGATGATGATGATCAGAACG CTACTTCTACATCATGTTCATCATCATCGTCTTCATTTAGTTTCTTTAGCTTTAGACCCTTCAATAAGCGCTTTCATTTCATTAACCCACCTCGTTCTTCCCTCAAACAAACCAAAAAACAGCAACGAACCCTTCAAACTAATGCCCCACCGCCACAAAGCAGCATCAGAAGACTCTTGAACTTGAACGATAATCCTAAAGATGATGGTGGTGGTGGAAATGATGATGATGATGATGATCAGAACGAGACTGCG GCGGGGGTCTTCTTATCTTGAGAACCATTGTTTATCGAACTCTGAACAGAAATCATCCACTTAGAATGCGCATCCTTTCGAGGCCACCGTGCCTCTCATCATATTCTGCTCCTTCTCGATCTCAATCACTCGCCAGACACAACTTCCATTTCTCAATTTCAACTTATTCTACTTCTACATCATGTTCATCATCATCGTCTTCATTTAGTTTCTTTAGCTTTAGACCCTTCAATAAGCGCTTTCATTTCATTAACCCACCTCGTTCTTCCCTCAAACAAACCAAAAAACAGCAACGAACCCTTCAAACTAATGCCCCACCGCCACAAAGCAGCATCAGAAGACTCTTGAACTTGAACGATAATCCTAAAGATGATGGTGGTGGTGGAAATGATGATGATGATGATGATCAGAACGAGACTGCGATTAAGGGGACAATTTTAGCTGGTTTATTGCTGGTGGGTGTTGTTGGTGGGTTTGGTACTGTTGGGTACATCTATAGAGACCAGATCAATGCTTTTCTGATTCAGTTTTCTAGCTTCATTGAAGGATATGGCCCTGCTGGATATGCACTTTTTGTTGCAGTTTATGCTGGCTTGGAGGTACTTGCAATACCCGCGATCCCACTGACAATGTCAGCGGGTCTTCTTTTTGGGTCATATACAGGCACAATTCTTGTCTCCATAAGTGGAACTGTGGCTGCAAGTGTTGCATTTCTAATTGCTAGATATTTTGCTCGTGATCGGATACTTAAAATGGTTGAAGGAAATAAAAAATTCCTTGCAATCGATAAAGCAATTGGAGAAAATGGTTTTAGAGTTGTCACACTTCTTCGTTTGAGCCCTTTGCTCCCGTTTT 5 0 5' arm Lactuca_saligna mirnest 100 100 -45.198 .....(((......((.((((((((((((((.((((((.(........((((..((....))...))))........).(((((.........((((.............................)))).........)))))..((((((((((.......((((.................................))))...)))))))))))))))).)))))))))))))).)).....)))..... (-45.198)