mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCCAAGTATCTTGGTTTTGCA CAGATTCTAAGATGCTTAATGC GGAGTGCATGTGCCAAGTATCTTGGTTTTGCAATAGGAGTGCATGAGTTGGACAACAGAACTCCATGAATTCTTTGTGGAAGGAGTCAACCAACTTGGCGGTAATGAAAGAGCTATACTAAAAGGAGTTTTGAAGCTCATTAATATTGAAAGTTTTACAATTTATCATGTGAAAAGTCATCTGCAGATTCTAAGATGCTTAATGCATTGTTCA ATTTTGCGGTCCTCTCATTCTTCTTGTCTACTCCGCCATGCGCCGCCTGCTCTGGAATCAGTAGTTCGGTTGGTGATAATGTTGAAAGGAGTGATTCACTTTGTTTAATAAGATAGTGCTACTGTTATGACTAAAGAAGAAGCTGCAAAGCTACTAAAGACCTACTTTAGCAGAGGCATAGTGGATGCATCAATTGATGTCATTGAGCCATTGACTTTGTGAAAAGAAAAGAAGGTCTCTAGGAATCATTGGAAGATGGAACACTATCATTCTTGAATATAGCATCACATCAACCATATTAAGGAGTGCATGTGCCAAGTATCTTGGTTTTGCAATAGGAGTGCATGAGTTGGACAACAGAACTCCATGAATTCTTTGTGGAAGGAGTCAACCAACTTGGCGGTAATGAAAGAGCTATACTAAAAGGAGTTTTGAAGCTCATTAATATTGAAAGTTTTACAATTTATCATGTGAAAAGTCATCTGCAGATTCTAAGATGCTTAATGCATTGTTCAACAAAAGTATGAGAATGCTCAACAAAAATACGAGGATGCTCAACAAAAGAATGTGAAGATTCAACAGAAAAATGTGGATGTTCAAGCAAATTTTGAATAACAACTTGCACGAACAATGAATAATGACTGTAATTAATACTTTGAGCTAACTGGTCAAAACCTTTATTAATCAATGATAAAATATTATGTA 4 1 5' arm Lactuca_sativa mirnest 100 100 -50.9 ..(((((((.....(((((((((((.((((((...(((((.......(((.....))).))))).(((.((((((...)))))).)))(((........))).((.((.(((((..(((......))).....))))).)).))..(((...(((((((........)))))))..)))..))))))..))))))))))).)))))))..... (-50.9)