mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG ACGAGTTGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTGAGTGGGAATATCGAGCTGCTGGTCTATGGACCCCTCAAGTCCTATCTTTGTTGTTGTATAGGCTTTGTGGCTTGCATACGCCAGGAGATTCATTATCCTTTTTCTGATCCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCTCCTCT CCTAACACTCTCTCTTCTCTTTTTCTAGGGTTTCCTGTGAGTAGGAAACATTAGTAAAGTTTTTGAGCAGCAGATGAAAGGAGCTAGATTTAACGAAGTCTAATTAAGGCTCATATTTCGTTGTCTTCTTGTGTTATCTGTCTAGATGTATGACGATTTCTTTGTTTTCTCTAACTACAAGGTTGCTTTAGGGCTTACGTCAGATGCTTTTGTGAAATCCTTGCACGAAAGACGAAAAAAAAAAACCCCGATTGTTCTAGCTAGGGAGGTTATGTATTGCTCTAGGTGTTGTCAAGTAAAGTTTTATATTTACTAAAATCACAAATGTTTGTTTATCCCAATTTGTGCCCTTCAATATATATATATGTGATATGATTTGTTTTCAAAAGAATAACGTAGTGATTTTGTGGGTGAACGAGTTGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTGAGTGGGAATATCGAGCTGCTGGTCTATGGACCCCTCAAGTCCTATCTTTGTTGTTGTATAGGCTTTGTGGCTTGCATACGCCAGGAGATTCATTATCCTTTTTCTGATCCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCTCCTCTTCTTTCGAGTACAGGGTTGGATCGAGGACTTTACTTTGACTAAACCTATTTGACGCCCTTTTCGTATAGTTCTCACTTCTCAATGTAAAACCCATCTTAAAAATTTCGGATCTTTTATTTGCCGTGTTTCTTTCTTATCTTAACCGAGTTCGGAAATTTTTACTTTTAGACGATGTCATTTTCAGATCATGTTTTTGAATGCATGGTGAGAAAAATATCTGAAAATGGTTGAATGTTAGATTTTCCCTAGATCTGTCCAACATTAGTTCACTATCTTTTATCTTATTG 3 0 3' arm Lactuca_sativa mirnest MIR159 0.00000005 rco-MIR159 0.00000001 -65.4 ..(((.....((((((((((((..(((((((.((((((((.(((.((((..((.((.((.(((((.((((((.((..((((.(((((............))))).)))).)).)).)))).))))).)).)).))..))))..))).))))))))..)))))))..)))))))))))).....))). (-65.4)