mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTCCTAGGCTACA TATGTGTAGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAGATATTCTTAGGTCTTTGTTTATCCATCTTTGAGTTCTTTTTCTATTTCTTAAAACCCCCCAAAAAAATCATACTCAAAAGGTCACGAAGGCACGCATTTGAAAATTTATATATCACCCATTAATCGTAAAGTTTATTAAAGATTCATAAGCTCCGGTTGGTTAACTGCATAAACTATTTATTGGCCTGTTTCGTTATTTTCGTGTATACGTACATAGGATAAGAAAGAAAGCATAACGTCGGCAAGTTGTCCTAGGCTACATATCTATC CATTTTTTCTACACCCAAAAATGTCCAAATGAAAAGACCATTTCCATATATAGAAATCAAGTCCCACAATTGACTCTTCTTTCCAACTAACGCATCCTATTTCCATAATTGAAAAAAAAGATTAAGCATTGATTCTTAATCTTCATCTTCATCACTATGTTCTTCATCCTCTTTCCACAATCCGAAAAAAGTTCCCACATTTGATCCTTTTCTTGTTTCGGTCTCATGGGAGATAAATTCATCCAAGTTCTTGCATGTGGAGACAAGTTATGTGTAGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAGATATTCTTAGGTCTTTGTTTATCCATCTTTGAGTTCTTTTTCTATTTCTTAAAACCCCCCAAAAAAATCATACTCAAAAGGTCACGAAGGCACGCATTTGAAAATTTATATATCACCCATTAATCGTAAAGTTTATTAAAGATTCATAAGCTCCGGTTGGTTAACTGCATAAACTATTTATTGGCCTGTTTCGTTATTTTCGTGTATACGTACATAGGATAAGAAAGAAAGCATAACGTCGGCAAGTTGTCCTAGGCTACATATCTATCATGTACTCACATGCTAGAACTATGATGAGCAGTATTCAAGATTGATATTGCAGAGAGTTGGGGGATATCATCTATGAAGTGTTTTTTATGGTACAAGCTGAAGTTGAAACAAATACTACAACANATTAATCAAGTTGCAGCAATGGTCTTCTTTACTTGACAAGGTATCTTTTTGTCTTTATTTACATTCCACATCCACCAAACAGGAATGTACAAAGGAATGAAATCC 2 0 5' arm Lactuca_sativa mirnest MIR169_2 8.0E-8 vvi-MIR169c 6.0E-8 -66.8 ........(((.((((.(((((((((((((((...(((.(((...(((((.(((((((...(((((((...((((......................))))....))))))).(((.((((((.((.((...((((..(((((.((......((((((((...(((((((.((...)).))))))).))))))))....)).)))))...))))...)).)))))))).)))...(((((....))))).))))))))))))))).)))...))))))))))))))).)))).)))....... (-66.8)