mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACCCTCTGTCTGTCACCC AAGGGTGGTGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCATGGTCTTTCTCGCAAATAGTGCGCTTTCATGTGCTTGAAGCTATGCGTGCTCACCCTCTGTCTGTCACCCCTGCTAT GCGGGGGCATGAACAGTACCTGGGGCCTTTAGCAGTGAAGCTTTGTACATATAGTTTCCTAGCTTAAGGATTGCACATGTCTAATCCATATTTTATCTATATCGCGGCAATCTATAAAGGTGAAGGGTGGTGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACCCATGGTCTTTCTCGCAAATAGTGCGCTTTCATGTGCTTGAAGCTATGCGTGCTCACCCTCTGTCTGTCACCCCTGCTATGTTTTTCTTCCAATCTATCCATATATATCTTTATTGTCTTTTTATCTTGCATGTCTATGATTAATATATAGTACCATATAGTTGCATGGGGTAAGGGAAGGAGAGCGGTGATTGAAGAGAGTGAGCACAGATGGGCTCTTCTTGCATGACATACGGAGTCATTTCGGAGAATTTGTAATTTTGTATGCCTAAAGTTAATTATGCGTGCTCAGGCTCTTTTTGTCAAG 1 1 5' arm Lactuca_sativa mirnest mir-156 0.000002 aly-MIR156f 0.000000001 -48.7 ...(((((.(((((((((((((.((((((((.((((((..(((..(((....(((......))).)))..))))))))).)))))))).)))).))))))))).))))).. (-48.7)