mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTGGAGGTGGTGCTGTGCCA AATGGAGCTGCCAAGCTAG TTGAGGCCGGTGAATGGAGCTGCCAAGCTAGCTTGGGTGGAGGTGGTGCTGTGCCACCGGCATGT CGGCCTTATGGCCTGTAGCCGGGGGAATGGTGGTGCTCACGGTAAACGAAACCATGCTCCAACTCGAATTCCAAGCATGGAATCCACTTGTTGCGGATAAGGTAGTCGATTTCCTTAGACAATGCCTCGTCGGACAATGGTGGTAGGTATGAAAGAGTCTCGTACTTCTTCAACCCAATTGGTGGCCACACCTTCATGCATTGTACTCTTCCACCGTTGCTGGGTAGGGATGAAAAGTCATTGTTAGCCTTCTTGGTAACTGGGAAAGCTACGTTAGACTTGAGGCCGGTGAATGGAGCTGCCAAGCTAGCTTGGGTGGAGGTGGTGCTGTGCCACCGGCATGTTGCAGTGGGGTTAAGGCAGTCAATAGCGCTGCAAAAACAACCCCTGATCGTCAGACGGCTTGTGGTTGTATAAAGAGTGCTTCTGCAAGCATGTCCAACATCAATGCGGGAAACGCTGCTAGCCTCCCCAACAAGTGTGGTGTTAACATCCCTTTACAGATCAGTCCAAGCACTGATTGCTCCAAGGTGCAGTGAGTCCGAGATGTTTATGCACGTTTTGGAAGATTTGAAGCATATATATCTAAATTACAAT 4 2 3' arm Lactuca_serriola mirnest 100 100 -26 .....(((((((.((((.((((((..(((......)))...)))))).))))..))))))).... (-26)